2. 四川大学华西临床医学院, 四川 成都 610041;
3. 四川大学出生缺陷与相关妇儿疾病教育部重点实验室, 四川 成都 610041
先天性心脏病(congenital heart disease, CHD) 的发病率约为 6‰ ~8‰[1]。根据我国 2012 年出生 缺陷防治报告资料,从 2005 年起,CHD 已跃居 我国出生缺陷首位,占所有出生缺陷监测病例的 26.7%(2011 年),是新生儿和婴儿期致残、致死 的重要原因[2]。目前 CHD 发病率整体呈上升趋势, 据估算我国每年新增 CHD 患儿将超过 13 万例。 目前对于 CHD 发病机制的研究主要集中在心脏发 育分子调控领域,其中小分子 RNA(mircoRNAs, miRNAs)作为近年来发现的一种表观遗传调控机 制,已经成为发育生物学的研究热点。
miRNAs 是一类在转录后水平调控基因表达的 小分子非编码 RNA,大小约为 22 个核苷酸。调控 方式主要通过靶向结合 mRNA,进而抑制或阻断 翻译[3,4]。在心血管系统疾病中,通过 miRNAs 表 达谱分析可以检测到多种 miRNAs 表达变化[5],它 们在心力衰竭、心律失常、心肌肥厚和心脏发育 等心血管疾病的发生演变及相关生物过程中起着 重要的调控作用[6,7,8,9,10]。
现阶段关于 miRNAs 在 CHD 中的研究可以分 为临床和动物研究两类,临床研究因取材于手术 或流产标本,其研究结果更具有代表性和应用价 值;动物实验研究因操作性更强,能进行更深入 的基因敲除和信号通路研究。本文就这两方面的 研究进展做一综述。 1 miRNAs 的结构与生物合成
miRNAs 是一类约为22 个核苷酸长度的具 有调控功能的非编码 RNA,其生物合成过程至 今尚未完全阐明。多数观点认为, miRNAs 基因 在 RNA 聚合酶Ⅱ、Ⅲ的作用下转录得到转录初 产 物(primary miRNA, pri-miRNA),pri-miRNA 在 RNA 聚合酶Ⅲ Drosha [11] 和 DiGeorge 综合征关 键 区 域 8 蛋 白(DiGeogre syndrome critical region 8,DGCR8) [12,13] 的协同催化下被剪切成60~70 个核苷酸长度的茎环状 miRNA 前体(precursor miRNA,pre-miRNA) [3,4] 。随后 pre-miRNA 被 RanGTP 依赖的 Exportin-5 转运体识别并从细胞核内转 运至胞浆,最终在胞浆中被 RNA 聚合酶Ⅲ Dicer 和 反 式 激 活 应 答 RNA 结 合 蛋 白(transactivating response RNA-binding protein, TRBP)剪切成含约 22 个核苷酸的具有基因沉默功能的成熟双链结 构[14,15]。 2 miRNAs 的调控机制与功能
成熟双链结构中的主导链(guide strand) 由 Argonaute 蛋白识别,并与 RNA 诱导转录沉默复合 物(RNA-induced silencing complex, RISC)结合, 形 成 miRISC,而 miRNAs 的 随 从 链(passenger strand)被迅速降解 [4]。miRISC 与 mRNA 的 3' 非 编码区(3' untranslated regions, UTRs)结合后可致 基因沉默,基因沉默的效果取决于 miRNAs 与靶基 因之间的互补程度,当二者互补不完全时仅抑制 翻译水平,完全互补时则会导致相应 mRNA 发生 降解[3,4]。
目前研究证实 miRNAs 在心肌细胞的增殖、 分化和凋亡、心脏神经嵴细胞的迁移、心脏形态发 生和心脏图式发育等诸多过程中起重要作用[9,16,17]。 miRNAs 具有功能丰余性(functional redundancy) 和上位联系性(epistatic relationships) [18],即一个 miRNA 可能有多个基因靶点、多个 miRNAs 也可 以共同调控一个基因靶点[19],故寻找其上下游靶 点及相关通路非常复杂,其实验设计及实施需十 分缜密。 3 miRNAs 与先天性心脏病
多数观点认为,心脏发育是一个多基因时空 调控的过程,实验研究证实 miRNAs 可参与心脏发 育的相关通路调控进而导致 CHD 发生[20]。
目前,miRNAs 在 CHD 发生机制中的研究可 分为临床及动物研究两类。因 miRNAs 在物种间具 有保守性,利于动物实验及临床研究结果进行比较 并相互促进;同时,miRNAs 还具有组织和发育阶 段特异性,如 miR-1 和 miR-133 在心肌和骨骼肌特 异性表达,并主要在新生和成年小鼠中表达[21], 利于研究特定组织细胞发育(如心脏发育组织) 的基因调控。 3.1 临床研究
miRNAs 的临床研究标本来源于 CHD 患儿手 术心脏标本或流产胎儿的心脏标本。
室间隔缺损(ventricular septal defect, VSD)是 最常见的 CHD 类型。Li 等[22] 发现与对照组儿童 相比,VSD 患儿心脏组织中 miRNAs 有显著变化, qRT-PCR 实 验 证 实 miR-1-1表达下调,而miR-181c 表达上调。Li 等 [22] 筛选并证实了 miR-1-1的 两个靶基因—GJA1 和 SOX9。SOX9 是心脏瓣膜和 间隔发育重要的调控基因,在心内膜垫的形成中 具有重要作用[23]。人类家系研究发现,SOX9 上游 区的增强子(如 Nkx2.5 和 Gata4)失调,与 CHD 发生有着重要关系[24] 。GJA1 基因编码连接蛋白 43 (Cx43),是主要的心脏缝隙连接通道。在大鼠 心肌梗死模型上,心肌 miR-1 的过表达可抑制靶 基因 GJA1 和 KCNJ2,引起 QRS 波增宽、QT 间期 延长等心律失常[25] ,而 miR-1 调控 GJA1 与 VSD 发生之间的关系还有待进一步阐明。Li 等[22] 还发 现,miR-181c 的 靶 基 因 是 BMPR2,BMPR2 基 因 编码骨形态发生蛋白(bone morphogenetic protein, BMP)2 型受体。Beppu 等 [26] 在小鼠中条件性基因 敲除 BMPR2,导致右心室双出口、VSD 和心内膜 垫缺损等心血管畸形。BMP2 及其受体是心脏发育 中间隔形成、瓣膜生成、房室管形态发生以及心 内膜垫上皮间质转化等过程所必需的[26,27]。
法洛四联症(tetralogy of Fallot, TOF)是存活 婴儿中最常见的青紫型 CHD。O'Brien 等[28] 发现, 与配对婴儿相比,TOF 患儿中共有 61 个 miRNA 显 著 变 化, qRT-PCR 验 证 显 示 miR-1275、miR-27b 和 miR-421 表达上调,而 miR-1201 和 miR-122 表达下调。miR-27b 过度表达可抑制靶基因 Mef2c 影响心脏发育中心肌生成过程(myogenesis),导 致心肌肥厚[29] 。研究显示,miR-27b 在心肌中的靶 点为过氧化物酶体增生物激活受体-γ(peroxisome proliferator-activated receptor-γ, PPAR-γ), PPAR-γ 抑制与心肌肥厚直接相关[30] ;miR-122 在 转基因模型小鼠(Pax-8 -/- mice)上的过表达可引 起左室壁和间隔区的细胞凋亡,导致 VSD 发生[31]。
然而,miRNA 表达具有时空差异性,取材于 出生后心脏标本的研究结果能否反映胚胎时期的 特征尚存在争议。与其他研究者不同的是,O'Brien 等[28] 收集了妊娠 90 d 的胎儿心脏标本作为研究 TOF 的胚胎学对照,发现只有 miR-1275、miR-421 和 miR-1201 的表达变化在胎儿期与出生后一致, 而在胎儿标本中,miR-122 表达上调,miR-27b 表 达下调,提示胎儿期与出生后患儿心肌中 miRNAs 的表达变化不尽相同,因此,胎儿期心肌标本或 能为 CHD 胚胎发育机制阐明提供更多的信息。如 果研究仅探讨出生后的疾病状态和进展 [如 TOF 中右心室肥厚的机理,二叶式主动脉瓣(bicuspid aortic valve, BAV)中的钙化机制],不涉及胚胎发 育成因,则不存在上述胚胎学代表性的疑问,这 种研究是非常有价值的。
Zhang 等 [32] 发现,与非配对捐赠心脏对照相 比, TOF 患儿心脏标本中有 47 个表达显著变化 的 miRNAs,其 中 16 个 表 达 下 调,31 个 表 达 上 调。生物学信息方法研究显示,促分裂原活化蛋 白 激 酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK) 通路相关的 6 个基因(MAPKAPK3、MAPK3K3、 MAPK3K5、MAPK3、MAPK9 和 TRAF2)可能是上 述 miRNAs 的靶点,参与了右心室肥厚的病变[32]。 有报道显示,与对照组相比,在 CHD 胎儿心脏 标本中 MAPK 通路分子蛋白有明显表达变化[33]。 Brown 等 [34] 发现在缺氧诱导的肺动脉高压小鼠模 型中,MAP3K2 参与了右室心肌肥厚的发生。
BAV 是重要的先天性心脏瓣膜疾病。Nigam 等[35] 采用 BAV 患者瓣膜标本进行 miRNAs 研究, 发现相对于主动脉瓣关闭不全组,主动脉瓣狭窄 组瓣膜中的 miR-26a、miR-30b 和 miR-195 表达下 调。体外 miRNAs 模拟体(mimic)细胞转染实验 证实 miR-26a 和 miR-30b 能抑制钙化相关通路的 mRNA 水平,miR-195 作用则相反,能使钙化相关 通路的 mRNA 水平提高,如 miR-26a 可抑制前钙 化基因(pro-calcification gene)BMP2,骨形态发生 蛋白-2(BMP2)基因在主动脉狭窄的瓣膜中有过 表达,参与了瓣膜的钙化[36]。
由于上述 CHD 大多预后良好,即使超声证实 这些 CHD 的存在,医学妊娠决策及孕妇、家庭的 意愿均指向继续妊娠及出生后治疗,因此缺乏这 些疾病胎儿期心脏标本的相关研究报道。然而对 于一些严重的复杂型 CHD,产前明确诊断后,部 分将被终止妊娠,在符合伦理和知情同意的情况 下可以选择这类 CHD 的胎儿心脏标本进行研究。
单心室(single ventricle, SV)是一种预后不 良的严重青紫型 CHD。Yu 等[37] 发现与对照组相 比,自然流产的胎儿单心室心脏标本中共有 48 个 miRNA 显著变化,其中 qRT-PCR 实验显示 hsamiR-214、hsa-miR-19b 和 hsa-miR-126 表达上调, hsa-miR-200a、hsa-miR-10a 和 hsa-miR-206 表达下 调,这 些 miRNAs 可 能 通 过 WNT 和 mTOR 通 路 参与了单心室心脏发育的调控。Liu 等[38] 发现, miRNAs 参与了小鼠神经发育中经典WNT 通路 (Wnt-β-catenin signaling)的调控。
目前国内通过手术标本进行 CHD 发生机制实 验研究很大程度上局限于对照组心脏标本的获取。 在Li等[22] 对 VSD 的研究中,28 例手术实验组只 有 7 例对照,且作者未明确指出对照组的人口学 信息是否配对,研究的难度可见一斑。国外组织 标本库(Tissue Bank for Developmental Disorders) 的建立使这方面的研究具有明显优势。如 Kuhn 等[39] 从标本库中取唐氏综合症的胎儿标本研究 miRNAs 的作用,发现 5 个人类 21 号染色体衍生 miRNAs(miR-99a、let-7c、miR-125b-2、miR-155 和 miR-802)过表达,这些 miRNAs 可能参与了唐 氏综合症患儿神经和心脏异常发育过程。 3.2 动物实验研究
miRNAs 的临床研究虽然具有代表性,但却 无法阐明与CHD 相关的miRNAs 中每一个具体 miRNA 的功能作用,也不能直接说明这些 miRNA 之间是如何相互作用并如何调控 CHD 的胚胎发育。 而动物实验研究既能直接针对某一 miRNA 在心脏 发育中的作用进行研究,也能获取心脏发育各个 时期 miRNAs 的表达规律并证明其与心脏发育的 相关性。目前基因敲除实验已经证明部分 miRNA 参与心脏发育过程,并且具有一定的表型特异 性,同时采取联合敲除等手段的实施,再次证明 miRNA 调控的复杂性和功能丰余性。
Liu 等 [40] 特异性地敲除了小鼠中的miR-133a-1 和 miR-133a-2基因,发现单一敲除miR-133a-1 或 miR-131a-2 的小鼠发育特征及心脏结 构与野生型基本相同,而联合敲除 miR-133a-1与 miR-133a-2 的小鼠约半数在胚胎期或出生早期死 亡,最为常见的心脏畸形为 VSD,其余存活至成 年小鼠也极易进展为扩张型心肌病和心力衰竭。 Liu 等 [40] 证实 miR-133a 可能通过 SRF 和 cyclin D2 基因调控心肌细胞增殖和凋亡。Chen 等[21] 研究发 现 miR-133a-1 和 miR-131a-2 具有相同序列且分别 位于小鼠 18 号染色体和 2 号染色体,它们在调控 小鼠心脏发育中有类似的功能。
在本世纪初,研究者发明了 Cre-loxP 重组系 统条件性基因敲除(conditional gene knock-out)技 术[41]。利用该项技术可以特异性敲除特定的发育 组织细胞(如心脏神经嵴细胞)中 miRNAs 合成的 必要 RNA 聚合酶Ⅲ Dicer 基因,而不影响其他组 织中的 Dicer 正常表达和 miRNAs 正常合成,这既 减少了广泛基因敲除可能导致的突变型高致死率, 又能证明 miRNA 在特定组织细胞发育中的调控作 用。Huang 等[17] 运用该技术条件性地敲除神经嵴 细胞系(neural crest cell lineage, NCCs)中的 Dicer 基因,培育出 Dicerflox/flox /Wnt1-Cre 小鼠,发现心脏 神经嵴细胞中丢失 Dcier 后,心脏图示发育受到严 重影响,导致诸如 B 型主动脉弓中断、右心室双 出口、VSD 等多种心血管畸形。上述提及的主要 研究概要见表 1。
![]() | 表 1 先天性心脏病发病机制中 miRNAs 作用的概要 |
miRNAs 的发现为阐释和研究基因表达调控、 生物过程异常调控和疾病发生提供了一个全新的 视角。虽然暂时对于 miRNAs 的生物学功能还知之 甚少,对其在心脏发育和先天性心脏病形成中的 作用也非常局限,但由于具有分子量小、作用特异、 组织细胞特异等优点,决定了 miRNAs 很好的研究 价值和临床应用前景。
[1] | Hoffman JI, Kaplan S. The incidence of congenital heartdisease[J]. J Am Coll Cardiol, 2002, 39(12): 1890-1900. |
[2] | 中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会. 中国出生缺陷防治报告(2012). [DB/OL] (2012-09-12) http://www.gov.cn/gzdt/att/att/site1/20120912/1c6f6506c7f811bacf9301.pdf. |
[3] | Bartel DP. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, andfunction[J]. Cell, 2004, 116(2): 281-297. |
[4] | Yates LA, Norbury CJ, Gilbert RJ. The long and short ofmicroRNA[J]. Cell, 2013, 153(3): 516-519. |
[5] | Ikeda S, Kong SW, Lu J, et al. Altered microRNA expression inhuman heart disease[J]. Physiol Genomics, 2007, 31(3): 367-373. |
[6] | Kumarswamy R, Thum T. Non-coding RNAs in cardiac remodeling and heart failure[J]. Circ Res, 2013, 113(6): 676-689. |
[7] | Kim GH. MicroRNA regulation of cardiac conduction andarrhythmias[J]. Transl Res, 2013, 161(5): 381-392. |
[8] | Pan W, Zhong Y, Cheng C, et al. MiR-30-regulated autophagymediates angiotensin II-induced myocardial hypertrophy[J].PLoS One, 2013, 8(1): e53950. |
[9] | Zhao Y, Ransom JF, Li A, et al. Dysregulation of cardiogenesis,cardiac conduction, and cell cycle in mice lacking miRNA-1-2[J]. Cell, 2007, 129(2): 303-317. |
[10] | Boettger T, Braun T. A new level of complexity: the role ofmicroRNAs in cardiovascular development[J]. Circ Res, 2012,110(7): 1000-1013. |
[11] | Zeng Y, Yi R, Cullen BR. Recognition and cleavage of primarymicroRNA precursors by the nuclear processing enzymeDrosha[J]. EMBO J, 2005, 24(1): 138-148. |
[12] | Faller M, Toso D, Matsunaga M, et al. DGCR8 recognizesprimary transcripts of microRNAs through highly cooperativebinding and formation of higher-order structures[J]. RNA, 2010,16(8): 1570-1583. |
[13] | Barr I, Smith AT, Senturia R, et al. DiGeorge critical region 8(DGCR8) is a double-cysteine-ligated heme protein[J]. J BiolChem, 2011, 286(19): 16716-16725. |
[14] | Chakravarthy S, Sternberg SH, Kellenberger CA, et al.Substrate-specific kinetics of dicer-catalyzed RNA processing[J].J Mol Biol, 2010, 404(3): 392-402. |
[15] | Haase AD, Jaskiewicz L, Zhang HD, et al. TRBP, a regulator ofcellular PKR and HIV-1 virus expression, interacts with Dicerand functions in RNA silencing[J]. EMBO Rep, 2005, 6(10):961-967. |
[16] | Chen J, Wang DZ. microRNAs in cardiovasculardevelopment[J]. J Mol Cell Cardiol, 2012, 52(5): 949-957. |
[17] | Huang ZP, Chen JF, Regan JN, et al. Loss of microRNAs inneural crest leads to cardiovascular syndromes resemblinghuman congenital heart defects[J]. Arterioscler Thromb VascBiol, 2010, 30(12): 2575-2586. |
[18] | Ambros V. The functions of animal microRNAs[J]. Nature,2004, 431(7006): 350-355. |
[19] | Hashimoto Y, Akiyama Y, Yuasa Y. Multiple-to-multiplerelationships between microRNAs and target genes in gastriccancer[J]. PLoS One, 2013, 8(5): e62589. |
[20] | Liu N, Olson EN. MicroRNA regulatory networks incardiovascular development[J]. Dev Cell, 2010, 18(4): 510-525. |
[21] | Chen JF, Mandel EM, Thomson JM, et al. The role ofmicroRNA-1 and microRNA-133 in skeletal muscle proliferationand differentiation[J]. Nat Genet, 2006, 38(2): 228-233. |
[22] | Li J, Cao Y, Ma XJ, et al. Roles of miR-1-1 and miR-181c inventricular septal defects[J]. Int J Cardiol, 2013, 168(2): 1441-1446. |
[23] | Akiyama H, Chaboissier MC, Behringer RR, et al. Essential roleof Sox9 in the pathway that controls formation of cardiac valvesand septa[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2004, 101(17): 6502-6507. |
[24] | Sanchez-Castro M, Gordon CT, Petit F, et al. Congenital heartdefects in patients with deletions upstream of SOX9[J]. HumMutat, 2013, 34(12): 1628-1631. |
[25] | Yang B, Lin H, Xiao J, et al. The muscle-specific microRNAmiR-1 regulates cardiac arrhythmogenic potential by targetingGJA1 and KCNJ2[J]. Nat Med, 2007, 13(4): 486-491. |
[26] | Beppu H, Malhotra R, Beppu Y, et al. BMP type II receptorregulates positioning of outflow tract and remodeling ofatrioventricular cushion during cardiogenesis[J]. Dev Biol,2009, 331(2): 167-175. |
[27] | Ma LJ, Lu MF, Schwartz RJ, et al. Bmp2 is essential for cardiaccushion epithelial-mesenchymal transition and myocardialpatterning[J]. Development, 2005, 132(24): 5601-5611. |
[28] | O'Brien JE Jr, Kibiryeva N, Zhou XG, et al. Noncoding RNAexpression in myocardium from infants with tetralogy ofFallot[J]. Circ Cardiovasc Genet, 2012, 5(3): 279-286. |
[29] | Chinchilla A, Lozano E, Daimi H, et al. MicroRNA profilingduring mouse ventricular maturation: a role for miR-27modulating Mef2c expression[J]. Cardiovasc Res, 2011, 89(1):98-108. |
[30] | Wang J, Song Y, Zhang Y, et al. Cardiomyocyte overexpressionof miR-27b induces cardiac hypertrophy and dysfunction inmice[J]. Cell Res, 2012, 22(3): 516-527. |
[31] | Huang X, Huang F, Yang D, et al. Expression of microRNA-122contributes to apoptosis in H9C2 myocytes[J]. J Cell Mol Med,2012, 16(11): 2637-2646. |
[32] | Zhang HS, Wu QY, Xu M, et al. Mitogen-activated proteinkinase signal pathways play an important role in right ventricularhypertrophy of tetralogy of Fallot[J]. Chin Med J (Engl), 2012,125(13): 2243-2249. |
[33] | 徐洁, 杨中州, 张姝, 等. 先天性心脏病胎儿心脏及胎盘组织中MAPK 及 Akt 信号通路分子的变化[J]. 中国当代儿科杂志, 2010, 12(5): 327-332. |
[34] | Brown RD, Ambler SK, Li M, et al. MAP kinase kinasekinase-2 (MEKK2) regulates hypertrophic remodeling of theright ventricle in hypoxia-induced pulmonary hypertension[J].Am J Physiol Heart Circ Physiol, 2013, 304(2): H269-H281. |
[35] | Nigam V, Sievers HH, Jensen BC, et al. Altered microRNAsin bicuspid aortic valve: a comparison between stenotic andinsufficient valves[J]. J Heart Valve Dis, 2010, 19(4): 459-465. |
[36] | Kaden JJ, Bickelhaupt S, Grobholz R, et al. Expression of bonesialoprotein and bone morphogenetic protein-2 in calcific aorticstenosis[J]. J Heart Valve Dis, 2004, 13(4): 560-566. |
[37] | Yu ZB, Han SP, Bai YF, et al. microRNA expression profilingin fetal single ventricle malformation identified by deepsequencing[J]. Int J Mol Med, 2012, 29(1): 53-60. |
[38] | Liu YG, Huang TW, Zhao XL, et al. MicroRNAs modulatethe Wnt signaling pathway through targeting its inhibitors[J].Biochem Biophys Res Commun, 2011, 408(2): 259-264. |
[39] | Kuhn DE, Nuovo GJ, Martin MM, et al. Human chromosome21-derived miRNAs are overexpressed in down syndrome brainsand hearts[J]. Biochem Biophys Res Commun, 2008, 370(3):473-477. |
[40] | Liu N, Bezprozvannaya S, Williams AH, et al. microRNA-133aregulates cardiomyocyte proliferation and suppresses smoothmuscle gene expression in the heart[J]. Genes Dev, 2008,22(23): 3242-3254. |
[41] | Nagy A. Cre recombinase: the universal reagent for genometailoring[J]. Genesis, 2000, 26(2): 99-109. |