中国当代儿科杂志  2014, Vol. 16 Issue (1): 518-523   PDF    
3例低血磷性抗维生素D佝偻病的基因诊断及文献复习
刘霜, 魏珉, 肖娟, 王长燕, 邱正庆     
中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院儿科, 北京 100730
摘要:对3例临床疑似X连锁低血磷抗维生素D佝偻病(XLH)患儿进行磷酸盐调节基因(PHEX)分析并确诊的临床资料进行回顾性分析及相关文献复习,探讨中国人存在的突变热点和突变类型。3例患儿均检测到PHEX基因突变,1例为无义突变(c.58C>T),2例为剪接突变(c.1645+1G>A,c.436+1G>A),其中c.436+1G>A为新突变。至2014年1月,世界上已报道的PHEX基因突变共有329个,错义突变占数量最多(24%),突变热点区域有3个。不同地区的病例总数和突变类型存在差异。中国人群中,89例XLH病人进行了PHEX基因检测,发现28种突变,其中在22外显子上发现的突变数量最多(18%),突变类型最多的为错义突变(61%)。总之,在中国人群中,XLH病人PHEX基因最常见的突变位置为第22外显子,最常见的突变类型为错义突变;c.436+1G>A 为PHEX基因的新突变。
关键词低血磷性抗维生素D佝偻病     X连锁显性     PHEX基因     突变     儿童    
Three PHEX gene mutations in Chinese subjects with hypophosphatemic rickets and literature review
LIU Shuang, WEI Min, XIAO Juan, WANG Chang-Yan, QIU Zheng-Qing     
Department of Pediatrics, Peking Union Medical College Hospital, Beijing 100730, China
Abstract: The clinical data of three Chinese children who had been definitely diagnosed with X-link dominate hypophosphatemic rickets (XLH) by gene mutation analysis of phosphate-regulating gene with homologies to endopeptidases on the X chromosome (PHEX) were retrospectively studied and the relevant literature was reviewed. PHEX gene mutations were detected in all 3 XLH children; a nonsense mutation (c.58C>T) in one case and splicing mutations (c.1645+1G>A, c.436+1G>A) in the other two cases. Among these mutations, c.436+1G>A was novel. As of January 2014, a total of 329 PHEX gene mutations were reported, primarily within three mutation hot spots, throughout the world. Missense mutations accounted for the highest proportion (24%) among all mutations. There is literature showing geographic differences in the total number of XLH subjects and PHEX mutation types across the world. In the current literature, 89 cases of XLH with 28 types of PHEX mutations have been reported in the population of mainland China. Exon 22 is the most frequent mutation site (18%) and missense mutations are the most common type of mutations (61%). It is concluded that exon 22 is the mutation hot spot and missense mutation is the most common type of mutation in the PHEX gene in Chinese XLH patients and that c.436+1G>A detected in this study is a novel PHEX gene mutation in Chinese with XLH.
Key words: Hypophosphatemic rickets     X-link dominate     PHEX     Mutation     Child    

X-连锁低血磷抗D佝偻病(X-linked hypophosphatemic rickets,XLH)是一组由于肾小管 磷酸盐转运异常和重吸收障碍,导致大量尿磷、 低血磷、骨质矿化缺乏和维生素 D 代谢异常的显 性遗传性疾病[1, 2, 3] 。其发病率为 1/20 000,是遗传 性佝偻病中最常见的一型[4, 5]。本病的临床表现在儿童主要为生长发育迟缓,身材矮小,骨骼疼痛, 行走无力,双下肢弯曲畸形,骨质疏松,多发性 骨折以及牙釉质发育不良[6];在成人,主要为软骨 病和骨关节畸形[7]。实验室检查可发现患者的血磷 明显降低,血钙正常,甲状旁腺激素正常或增高 以及血 1,25-羟维生素 D3正常或轻度下降[8]

HYP Consortium 于 1995 年证明磷酸盐调节 基因 (PHEX)为此病的致病基因[9]。此基因 (OMIM300550)定位于染色体 XP22.1-22.2,全 长 243 kb,由 22 个外显子构成,其编码的跨膜蛋 白含 729 个氨基酸,属于二型锌依赖性内肽酶家 族整合蛋白的成员。研究证实人类和小鼠的 PHEX 序列有 96% 的同源性[10]。自 1986 年刘向善[11] 报 道了中国第 1 例低磷抗维生素 D 佝偻病以来,国 内对该病的研究多为病例报道,分子遗传学研究 报道数量较少。本研究报道国内 3 例基因诊断明 确的 XLH,并复习以往相关文献,探讨中国 XLH 患者存在的突变热点和突变类型,以提高对该疾 病的认识。 1 资料与方法 1.1 研究对象

研究对象为我院2011年11月至2012年6月 疑诊为 XLH 的 3 例患儿,其中男 1 例,女 2 例, 年龄 3~9 岁,1 例有家族史(母亲患病),2 例为 散发病例。 1.2 诊断标准

由于国内外对于低磷抗维生素 D 佝偻病没 有严格统一的标准,参考诸福棠实用儿科学[12], XLH 的临床特点为:于生后第 1 年出现典型的双 下肢弓形腿,伴身高增长慢,无手足抽搐;在儿 童期,常有颅缝晚闭,四肢大关节可发生致畸性 骨痛关节炎,可有出牙晚,牙痛,牙齿易脱落; 血清钙正常,血清磷明显降低合并尿磷增高(肾 小管磷重吸收率降低),碱性磷酸酶升高,甲状 旁腺功能可正常或轻度升高,双膝放射线检查可 有典型佝偻病改变。回顾性分析了 3 例患儿的临 床资料,患儿均有身材矮小、佝偻病、低磷血症、 尿磷增高等表现,符合 XLH 的临床特点(表 1)。

表1 12 3 例患儿的临床资料
1.3 DNA 提取

取得患儿监护人知情同意后,留取患儿及其 父母外周静脉血 2 mL(肝素抗凝),用博迈德全 血基因组提取试剂盒提取基因组 DNA,测定浓度 后 -20℃留存备用。 1.4 PCR 扩增

通过 UCSC 数据库(http://genome.ucsc.edu/) 得 到 PHEX 基 因 序 列(NM_000444),应 用 Primer 3.0 设计引物,对 PHEX 基因的 22 个编码 外显子及其相邻的内含子序列进行 PCR 扩增。 在 20 μL 反应体系中,含 10×PCR 缓冲液 2 μL, 2.5 mmol/L 的 dNTP 3 μL,5 U/μL 的 rTaq 酶 0.3 μL 大连宝生物有限公司),100 ng/μL 基因组 DNA 1 μL,正反向引物各1 μL,去离子水 11.7 μL。PCR 反应条件为:95℃ 预变性 5 min,94℃变性 30 s,59℃退火 30 s,72℃延伸 45 s,共 35 个循环, 最后 72℃延伸 5 min。PCR 产物送北京天一辉远公 司切胶纯化和基因测序。 1.5 突变的证实

针对所发现的突变首先进行反向测序,结果 与 UCSC 数据库基因组序列进行比对分析,进一步 检测患儿父母外周血 DNA,了解是否也能发现相 同位点的突变。 2 结果 2.1 临床特点

3 例患儿中,1 例男性患儿以前额突出就诊, 2 例女性患儿以双下肢弯曲就诊。起病年龄为 5 个 月至 2 岁,诊断年龄为 2~3 岁。就诊时患儿身高 均小于 -3 SD,且均有膝内翻、步态不稳和方颅。 肋骨串珠 1 例,肋缘外翻 2 例,牙齿脱落 1 例。 3 例病例血清磷明显降低(0.70~0.86 mmol/L), 24 h 尿磷明显增高(1.05~1.43 mmol/kg)。血碱性 磷酸酶升高(490~949 U/L)。1 例患儿血甲状旁 腺激素升高(109 pg/mL)。3 例患儿双上肢 + 下 肢 X 片显示符合佝偻病征象(双侧肱骨、尺桡骨、 胫腓骨骨干弯曲,骨质密度减低,干骺端呈杯口状, 毛刷样改变,干骺端发育延迟)(图 1)。病例 3 在 1.5 岁初诊时外院曾误诊为维生素 D 缺乏性佝偻 病,此后手术矫正 O 型腿 3 次。

图 1 病例 1 的影像学表现   尺桡骨 X 片显示:骨干弯 曲,骨质密度减低,干骺端呈杯口状,毛刷样改变,干骺端发育 延迟。
2.2 基因突变检测结果

将 PHEX 的 22 个编码外显子的测序结果与 正常序列比对,发现 3 例病例均存在基因突变, 包括无义突变和剪接突变 2 种类型。其中已报道 的突变有 2 例:外显子 1 上碱基序列 58 处的胞 嘧啶由胸腺嘧啶代替,从而导致终止密码的产生 (c.58C>T,p.R20X)及在第 15 外显子和内含子 连接处发生单碱基置换(c.1645+1G>A)。新发现 的突变 1 例,为第 4 内含子起始处的剪接位点发 生的改变(c.436+1G>A)。病例 1、3 的父母均未 检测到突变,病例 2 和其母亲均检测相同突变, 其父亲未检测到突变(图 23)。

图 2 病例 1、3 的测序结果   A:病例 1 测序图,显 示在第15 外显子和内含子连接处发生单碱基置换(c.1645+1G>A); B: 病例 3 测序图,显示第 4 内含子起始处的剪接位点发生的改变 (c.436+1G>A)。此 2 例突变均为剪接突变。箭头所示为突变位点。

图 3 病例 2 及其母亲的测序结果   A:病例 2 测序图, 显示在第 1 外显子上第 58 处的胞嘧啶由胸腺嘧啶代替,从而导致 无义突变(c.58C>T,p.R20X);B:病例 2 的母亲测序图,显示 在相同位点发现同样突变。箭头所示为突变位点。
2.3 文献复习结果

至 2014 年 1 月,世界上已报道的 XLH 患者 PHEX 基因突变共有 329 种,覆盖了 PHEX 基因的全长(http://www.phexdb.mcgill.ca/)。其中最常见 的为错义突变(24%),突变热点区域有 3 个:外 显子 8~10,外显子 14~17 和外显子 19~22[13]。不 同地区的病例总数和突变类型存在差异,欧洲 267 例报道中最常见的突变为框移突变(24%);美 洲 10 例报道中最常见的为错义突变(40%);亚 洲 51 例报道中最常见的为无义突变(31%)[14]。 经 过 检 索 Pubmed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ pubmed)和万方(http://www.wanfangdata.com.cn/) 数据库,共检索到 12 篇关于中国 XLH 患者进行 PHEX 基因检测的报道。12 篇文献共报道 89 例 XLH 病人,发现 28 种突变,其中在 22 外显子上 发现的突变数量最多(18%),突变类型最多的 为错义突变(61%)(表 2)。文献曾报道在欧洲 地区 XLH 患者中,散发病例占病人总数的 40%, 而 PHEX 基因突变检出率在有家族史的病人中是 87%,在散发病例中是 73%。中国已报道的 89 例 XLH 病人中,28 例为散发病例,PHEX 基因突变 检出率为 100%,61 例有家族史,PHEX 基因突变 检出率为 88%(54/61)[3, 7, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22]。本组资料的3 例 患儿中,1 例有家族史,2 例为散发病例,均检出 PHEX 基因突变。

表 2 中国人群 PHEX 基因已知突变
3 讨论

病例 2 检出的无义突变(c.58C>T,p.R20X) 位于外显子 1 上,处在 PHEX 编码的跨膜蛋白 N 端的胞质侧,使 mRNA 第 20 位的精氨酸处终止转 录,从而造成蛋白的截短。Dixon 等[23] 于 1998 年 曾预测大部分(70%)发生在 PHEX 基因上的突 变会导致其蛋白功能的丧失,而并不是由于单倍 剂量不足或者显性负效所导致。迄今为止,世界 上发现此突变的报道共有 7 例,病例人群覆盖的 地域包括了俄罗斯、芬兰、波兰、德国、比利时 和韩国,在中国人群中还未见报道[4, 23, 24, 25, 26, 27, 28]。2000 年 Tyynismaa 等 [26] 曾推测此突变没有人种特异性,为 常见的突变之一。在病例 1 和其母亲检测出的剪 接突变(c.1645+1G>A)位于 15 外显子和内含子 的 5’剪接供体位置处。最初于 2001 年在澳大利 亚被报道,迄今共报道 8 例患者[2, 29, 30, 31]。虽然此突 变所导致的 RNA 剪接效应和蛋白功能研究尚不足, 此位点在恒河猴、小鼠、狗等物种中都极度保守, 且此处 5’端的剪接强度根据 Neural Network 剪接 预测软件(www.fruitfly.org/seq_tools/splice.html)分 析后,发现此处为 G 的剪接强度为 0.96(正常值 0~1),变为 A 后剪接信号极为微弱(<0),且根 据数据分析,此处的突变也可能影响 15 内含子的 3’剪接受体,从而导致外显子跳跃。而病例 3 检 测出的剪接突变(c.436+1G>A)为一例新突变。 在内含子 4 上剪接位点的突变共有 4 例报道,分 别为 c.436+4A>C,c.436+3G>C,c.436+6C>T 和 437-3C>G [29, 32, 33] 。除了荷兰在 2008 年报道的 c.436+6C>T 从 RNA 水平上证实了此剪接突变导致了外显子 4 的跳跃剪接外,余报道均未做相关功能的研究[33]。 本研究报道的突变经过 Neural Network 预测后发现 此处 5’端 G 的剪接强度为 0.92,而变为 A 后强 度为 0.1,所以预测此突变会导致错误剪接。 目前,PHEX 基因的基因型和表型没有发现联系[14]。XLH 患者的临床表现多样,且严重程度 差异很大,主要是靠家族史和临床表现诊断。此 病在儿童期主要表现为生长发育迟缓,包括双下 肢弯曲、出牙延迟和方颅[6] 。Drezer [6]在2000 年分析, XLH 患者的大部分症状在6~12 个月之后才会出现, 而且对于没有家族史的患者,80% 在 2~3 岁以后 因为双下肢弯曲而就诊。在中国已报道的 89 例 病人中,可获取资料的为 42 例,其中小于 18 岁 的 22 例,平均诊断年龄为 6 岁。所有患者就诊原 因均为双腿弯曲,其中有 20 例发现方颅,且起病 平均从 6 个月开始,首发症状均为生长迟缓和方 颅[3, 13, 16, 19]。本组资料中的 3 例患者诊断平均年龄 为 5 岁,均发现方颅。病例 1 从 5 个月开始出现 前额突出,家长未予重视,病例 2 和 3 出现方颅 的时间不详。因此推测 1 岁以内 XLH 的患儿可以 通过方颅等早期佝偻病的体征及时诊断,从而进 行早期治疗。根据文献报道,XLH 病例的骨骼畸 形随年龄增长而逐渐加重,早期及时的诊断和长 期的治疗是决定患者预后的关键[6, 34]

本研究中,病例 3 曾在 1.5 岁由外院误诊为维 生素 D 缺乏性佝偻病。而国内也有多篇文献分析 了 XLH 患者的误诊,主要被误诊的疾病皆为维生 素 D 缺乏性佝偻病[34, 35]。XLH 是一种以低磷血症 为特征导致骨发育和营养不良的遗传性骨病,有 阳性的家族史,与维生素 D 缺乏性佝偻病相比, 主要特点为:血磷降低显著,尿磷增高,血钙正 常或稍低,罕有抽搐。佝偻病在 2 岁以后仍有活动, 病情持续进展;而后者血磷正常,血钙降低显著, 严重者出现婴儿手足搐搦症。1,25-(OH)D3 下降明 显。佝偻病在 2 岁后进入后遗症期,没有活动性, 病情不进展。XLH 对于常规剂量维生素 D 和钙剂 治疗无效,本病需磷酸盐合剂和大剂量维生素 D 同时治疗方可有效,以上几点可作为鉴别诊断的 主要方法。另外,佝偻病方面 XLH 还需要和原发 性肾小管酸中毒、范可尼综合征等鉴别。

PHEX 基因作为 XLH 的致病基因,几乎所有 的 PHEX 基因突变均会使 PHEX 在成骨细胞表面 的功能受损。PHEX 在骨骼、牙齿、脑、肌肉、睾 丸中均有表达,但在肾脏中无表达,说明 PHEX 蛋白异常不是直接作用于肾脏来影响磷的回收和 维生素 D 的代谢[36]。Shimada 等[37] 和 White 等 [38] 多次在实验中证实 FGF-23 作为重要的调磷因子,是 PHEX 蛋白的分解底物。当 XLH 患者基因突变 时,其作用底物堆积,FGF-23 的浓度在患者体内 显著升高,从而影响肾小管对磷的重吸收。2012 年美国内分泌协会将 XLH 与常染色体显性遗传性 低磷性佝偻病(ADHR)、常染色体隐性遗传性佝 偻病(ARHR)、肿瘤诱发的骨软化症(TIO)等 8 种疾病分类于 FGF-23 介导的低磷血症 [39]。可以 说 FGF-23 的检测对于 XLH 的患者具有重大意义。 由于技术所限,本研究并未检测患儿体内的 FGF-23 水平,以后应当开展此部分的工作,以对 XLH 进行更加深入的探索。

综上所述,本研究从临床和基因水平上确诊 了 3 例 XLH 病例,此 3 例患儿 PHEX 基因突变在 中国人群中均是首次报道,在国际上其中 2 例为 已报突变,1 例为新突变。另外,本研究还对相 关文献进行了复习和总结,发现中国 XLH 病人在 PHEX 基因报道中最常见的突变位置为第 22 外显 子,最常见的突变类型为错义突变。今后,我们 需要对中国 XLH 的病例进行更大样本的研究,以 明确最常见的突变热点,以及在分子遗传学上面 对基因型和表型的联系进行进一步的探讨。

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