中国当代儿科杂志  2014, Vol. 16 Issue (1): 629-633   PDF    
甲基丙二酸血症患儿血浆microRNA表达变化的初步研究
李燕飞, 彭涛, 段冉冉, 王笑寒, 高慧丽, 王景涛, 滕军放, 贾延劼     
郑州大学第一附属医院神经内科, 河南 郑州 450052
摘要目的 筛选甲基丙二酸血症(MMA)患儿血浆中表达差异的microRNA(miRNA),并检测miR-9-1 在MMA 患儿血浆中的表达变化,初步探讨miR-9-1 作为MMA 潜在的生物标记物的意义。方法 收集17 例MMA 患儿血浆样本,其中MMA 合并高同型半胱氨酸血症12 例(MMA+HHcy 组)、不伴高同型半胱氨酸血症的MMA 5 例(MMA 组);另收集10 例非MMA 的高同型半胱氨酸血症(HHcy 组)和10 例健康对照者的血浆样本。采用miRNA 微阵列基因芯片法筛选具表达差异的miRNA,选择具有表达差异的miR-9-1 行RTPCR法检测血浆中miR-9-1 的表达。选择经维生素B12 治疗的MMA 患儿检测治疗后血浆miR-9-1 表达的变化。结果 miRNA 微阵列基因芯片共筛选出26 个具有表达差异的miRNA,其中下调2 倍以上的miRNA 16 个(包括miR-9-1),上调2 倍以上的10 个。MMA+HHcy 组、MMA 组及HHcy 组 miR-9-1 的表达量较健康对照组均显著下调(P<0.01)。维生素B12 治疗反应良好的患儿治疗后血浆中miR-9-1 较治疗前显著上调,与健康对照组比较差异无统计学意义。结论 miR-9-1 在MMA 患儿血浆中显著下调,维生素B12 治疗后显著上调,可作为监控MMA 病情变化的指标。
关键词miR-9-1     甲基丙二酸血症     高同型半胱氨酸血症     儿童    
A preliminary study of plasma microRNA levels in children with methylmalonic acidemia
LI Yan-Fei, PENG Tao, DUAN Ran-Ran, WANG Xiao-Han, GAO Hui-Li, WANG Jing-Tao, TENG Jun-Fang, JIA Yan-Jie     
Department of Neurology, First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou 450052, China
Abstract: Objective To screen out differentially expressed microRNAs (miRNAs) in the plasma of children with methylmalonic acidemia (MMA), to determine the expression of miR-9-1 in plasma and to preliminarily evaluate the significance of miR-9-1 as a biomarker in MMA. Methods Plasma was obtained from 17 MMA children, 10 hyperhomocysteinemia (HHcy) children without MMA (HHcy group), and 10 normal controls. Of 17 MMA children, 12 had HHcy (MMA+HHcy group), and 5 had no HHcy (MMA group). The differentially expressed miRNAs were screened out by miRNA microarray. Differentially expressed miR-9-1 was selected, and plasma miR-9-1 levels were determined by RT-PCR. Urine was collected from MMA patients who received vitamin B12 treatment, and plasma miR-9-1 levels were determined by RT-PCR after treatment. Results The miRNA microarray analysis showed that 26 miRNAs were differentially expressed, among which 16 miRNAs (including miR-9-1) were down-regulated over 2 times, while 10 miRNAs were up-regulated over 2 times. The MMA+HHcy, MMA and HHcy groups had significantly down-regulated miR-9-1 compared with the normal control group (P<0.01). The patients who showed a good response to vitamin B12 treatment had significantly increased plasma miR-9-1 levels, without significant difference compared with the normal control group. Conclusions Plasma miR-9-1 is significantly down-regulated in MMA patients, but it is significantly up-regulated after vitamin B12 treatment, suggesting that miR-9-1 may act as a biomarker in monitoring the progression of MMA.
Key words: miR-9-1     Methylmalonic academia     Hyperhomocysteinemia     Child    

甲基丙二酸血症(methylmalonic acidemia, MMA) 是由甲基丙二酰辅酶A 变位酶 (methylmalonyl-CoAmutase,MCM)或其辅酶腺苷 钴胺素(Ado-Cb1)缺陷导致的一种常染色体隐性 遗传代谢性疾病。其患病率在美国为1 : 48 000, 日本为1 : 50 000[1],国内患病率尚不清楚,但对临 床疑似患儿进行串联质谱检测发现MMA 患儿并不 少见[2]。正常情况下,甲基丙二酸在MCM 和Ado- Cbl 作用下转变成琥珀酰辅酶A 参与三羧酸循环, MCM 活性不足或维生素B12 代谢障碍可导致甲基 丙二酸及其前体丙酸、甲基枸橼酸等代谢物的异 常蓄积,从而引起神经、肾脏、肝脏等多系统损 伤[3, 4]。微小RNA(microRNA,miRNA) 是一类 长约22 个核苷酸的非编码单链RNA,它可以通过 与靶基因的3' 端非翻译区(3'-UTR)互补配对抑 制基因转录后表达,从而参与细胞增殖、分化、 发育、凋亡等多种生物过程。近年来研究表明, miRNA 在疾病状态下可异常表达且具有检测方法 灵敏、准确等特点,这提示miRNA 可能作为潜在 的生物标记物辅助相关疾病的诊断[5]。生物信息 学工具预测发现miR-9 有众多可预测的下游靶基 因,而研究亦证实miR-9 在生物发育、细胞增殖、 凋亡和神经前体细胞分化过程中起着重要的调控 作用。本研究通过检测MMA 患儿与健康人之间 miRNA 的表达差异,以寻找合适的生物标志物来 辅助MMA 的诊断。 1 资料与方法 1.1 研究对象

所有MMA 病例来自2011 年8 月至2013 年6 月就诊于郑州大学第一附属医院及郑州 大学第三附属医院的患儿,共收集17 例MMA 患儿、10 例非MMA 的高同型半胱氨酸血症 (hyperhomocysteinemia)患者及10 例健康对照者 的血浆样本。MMA 患儿的诊断标准参照文献[6]。 尿液样本送至北京儿童医院进行气相色谱- 质谱 (GC-MS)定量测定甲基丙二酸含量。结合临床表 现、影像学及生化学检查后确诊为MMA。

17 例MMA 患儿根据血浆同型半胱氨酸 (Hcy)水平进行分组:Hcy>16 μmol/L 者为MMA 合并HHcy 组(MMA+HHcy 组,12 例);Hcy ≤ 16 μmol/L 者为MMA 未合并HHcy 组(MMA 组, 5 例)。上述病例中经维生素B12 治疗并具有一定 家庭经济能力的5 例患儿于治疗3 周后将其尿液 样本送至北京儿童医院复查GC/MS。

由于单纯HHcy 在青少年中少见,故本研究 中HHcy 组年龄较其他各组大(P<0.05),余各组 间性别,年龄差异无统计学意义。各组患儿临床 基本资料见表 1

表 1HME 家系基本临床资料

采集患儿资料并建立档案,留取外周血。本 研究经我院医学伦理委员会批准,患儿家长知情 并签署知情同意书。 1.2 主要试剂

miRcute miRNA isolation Kit(DP501) 购自Tiangen 公司,Reverse Transcriprition System(A3500)、Gotaq qPCR Master Mix (A6001) 购自Promega 公司,miR-9-1 引物购 自广州锐博生物科技有限公司( 序列Forward 5'-TCATAAAGCTAGATAACCGAAGAT-3'; Reverse 5'-TCCAGAGGCGACCCAGAGC-3')。 1.3 血浆标本的收集

参照Kim 等[7] 方法,抽取患儿外周血3 mL, 收集于氟化钠(NaF)管中,采用4℃、3 000 r/min 离心15 min,取上层血浆置于-80℃冰箱备用。 1.4 血浆miRNA 的抽提

按照miRcute miRNA 提取分离试剂盒说明书 进行抽提miRNA。 1.5 微阵列基因芯片

选取MMA 患儿和健康对照各5 例进行 miRNA 微阵列基因芯片检测,其中MMA 组男3 例, 女2 例,平均年龄13.4±2.1 岁; 对照组男2 例, 女3 例,平均年龄13.4±1.7 岁。两组性别、年龄 差异无统计学意义(P>0.05)。

由 LC Sciences 提供技术服务,在 MMA 患儿 和健康对照组血浆 miRNA 3' 端加上poly(A)尾, 并将寡聚核苷酸标记与 poly(A) 尾连接。将标记 产物、含有 25% 甲酰胺的 100 μL 6xSSPE 缓冲液 混合后在 LC Sciences 微阵列基因芯片上杂交过夜, 杂交温度为34℃。杂交后与标记特异结合的 Cy3 染料进行染色。利用GenePix 4000B 采集杂交图像 并使用Array-Pro 进行图像数字化转换。所得数值 减除背景值后,采用 LOWESS 法进行信号归一化, t 检验进行两组差异表达基因分析。 1.6 RT-PCR

MMA+HHcy 组、单纯MMA 组、单纯HHcy 组及MMA+HHHcy 治疗组(经维生素B12 治疗并 复查尿甲基丙二酸含量)进行实时荧光定量PCR (RT-PCR)检测。另检测10 例健康儿童作为对照。

根据 Reverse Transcription System 说明书,将 miRNA 逆转录为cDNA。按照Gotaq qPCR Master Mix 说明书进行荧光定量检测,以5S 为内参。记 录相应的Ct 值,miRNA 相对表达量采用公式2-△△ Ct 方法计算,每例样本重复3 次,整个实验采用盲法。 1.7 统计学分析

采用 SPSS 17.0 统计软件进行统计学分析。计 量资料采用均数± 标准差或中位数(四分位数) [M(P25,P75)] 表示,正态分布连续变量资料采 用t 检验,非连续变量资料采用卡方检验,非正态 分布连续变量资料采用秩和检验,相关性分析采 用Pearson 相关性分析方法,P<0.05 为差异有统计 学意义。 2 结果

2.1 尿液甲基丙二酸倍率

GC-MS 测定尿液甲基丙二酸倍率( 倍率 = 分析值/ 基准值,基准值为0.001) 显示, MMA+HHcy 治疗组甲基丙二酸倍率显著低于 MMA+Hcy 组及 MMA 组(P<0.01),见表 2

表 2HME 家系基本临床资料
2.2 miRNA 在MMA 患儿血浆中的表达变化

miRNA 微阵列基因芯片筛选出具有表达差异 的miRNA 有 26 个,其中上调2 倍以上的有miR- 144-3p、miR-4687-3p、miR-30c-1 等10 个,下调 的有miR-9-1、miR-191-5p、miR-30a-5p 等16 个,见 图1

图 1 微阵列芯片聚类图  上调2 倍以上的有miR-144- 3p、miR-4687-3p、miR-30c-1 等10 个,下调的有miR-9-1、miR- 191-5p、miR-30a-5p 等16 个。

MMA + HHcy 组miR-9-1 相对表达量为 (1.11±0.95)×10-3,MMA 组为(2.46±2.91) ×10-2,HHcy 组为 0.161±0.119,MMA+HHcy 治 疗组为0.214±0.023,健康对照组为0.250±0.103, 其中MMA+Hcy、MMA 及HHcy 组与健康对照组比 较差异均有统计学意义(P<0.01),MMA+HHcy 治疗组与健康对照组比较差异无统计学意义,见图 2 ;且在 MMA+HHcy 组及 MMA 组中 甲基丙二 酸倍率值越高,miR-9-1 相对表达量越低,相关 系数分别为-0.789、-0.867,见图3A、3C,而在 MMA+HHcy 组及HHcy 组中 miR-9-1 相对表达量 与血Hcy 值无相关性,见图 3B3D

图 2 各组 miR-9-1 的相对表达量    a 为与NC 组( 健 康对照) 比较,P<0.01;b 为与MMA+Hcy 组比较,P<0.01。 


图 3   miR-9-1 表达与尿甲基丙二酸倍率、血Hcy 值 的相关性     A:MMA+HHcy 组,尿甲基丙二酸倍率与miR-9-1 表达呈负相关(r=-0.789,P=0.007);B:HHcy 组,miR-9-1 表 达与血Hcy 值无相关性;C:MMA 组,尿甲基丙二酸倍率与miR- 9-1 表达呈负相关(r=-0.867,P=0.04);D:MMA+HHcy 组, miR-9-1 表达与血Hcy 值无相关性。

2.3 miR-9-1 对MMA 的诊断效能

ROC 曲线分析结果显示,利用 miR-9-1 的相 对表达量对 MMA 进行诊断时,ROC 曲线下面积为 0.974。若以0.027 为诊断临界值,即miR-9-1 相对 表达量低于0.027 时诊断为MMA,约登指数最大, 为0.832,灵敏度和特异度分别为0.95、0.882,见图 4

图 4 通过血浆miR-9-1 相对表达量诊断MMA 的曲线下面积(AUC)  

3 讨论

本研究发现MMA+HHcy 组及MMA 组中甲基 丙二酸倍率越高,miR-9-1 相对表达量越低,而在 MMA+HHcy 组及HHcy 组中血Hcy 值与miR-9-1 相对表达量无相关性。这提示MMA 患儿甲基丙二 酸蓄积量可能在miR-9-1 的下调中起主导作用,而 MMA+HHcy 组miR-9-1 相对表达量明显低于MMA 组及HHcy 组,则可能是由甲基丙二酸及Hcy 的 共同作用引起。MMA+HHcy 治疗组复查尿甲基丙 二酸倍率较治疗前显著下调,提示患儿治疗后病 情控制较好,此时检测miR-9-1 相对表达量明显上 调,基本恢复正常人水平,推测miR-9-1 可能是反 映治疗效果及病情状况的一个指标。

MMA 造成脑损伤的机制尚不十分明确,有研 究表明其可能通过抑制三羧酸循环途径以及氧化 磷酸化,导致线粒体功能障碍,诱发氧化应激以 及兴奋性毒性,从而诱导神经元细胞发生凋亡[8, 9]。 最新研究发现将 甲基丙二酸经皮下注射至 Wistar 大鼠体内可引起大鼠血液中多形核白细胞的减少 及皮质组织中 IL-1β、TNFα、iNOS 表达水平的 增高,由此推测神经炎症机制可能参与了 MMA 患 儿脑损伤的过程[10]

关于 miR-9-1 在 MMA 中的作用机制,目前国 内尚无相关报道。研究表明miR-9-1 可能对炎症 因子起到一定的抑制作用。如Jones 等[11] 报道在 人骨关节炎软骨细胞过表达miR-9 可使IL-1β 诱 导产生的 TNFα 减少40%,提示miR-9 可能对骨 关节炎疾病起到保护作用。Kaneko 等[12] 在交感性 眼炎患儿的眼球样本中发现miR-9 下调,并证实 miR-9 可负调控靶基因TNFα 及NF-κB1,而后二 者与线粒体氧化应激介导的光感受器凋亡有关。 Bazzoni 等[13] 研究发现TLR-4 激活的NF-κB1 可诱 导多形核中性白细胞与单核细胞中的miR-9 上调, 而miR-9 形成的负反馈通路可对 NF-κB 家族成员 的表达进行调控。本研究发现miR-9-1 在MMA 患 儿血浆中下调,为国内首次报道,推测可能是由 于MMA 引起的炎症反应超过了miR-9-1 的抑制 作用,这为miR-9-1 是否可作为MMA 治疗靶点 提供了新思路。但亦有一些报道不能解释本研究 发现,如Liu 等[14] 报道在由LPS 介导的炎症反应 中miR-9上调,提示其与炎症反应有关;还有研 究发现miR-9 可在转录后水平抑制NF-κB1 表达, 而后者已被证实具有抗凋亡作用[15, 16],故miR-9-1 在MMA 中下调的原因和机制尚需进一步研究。而 miR-9-1 表达水平与MMA 进展过程的深层关系仍 需进一步扩大样本量进行验证,miR-9-1 在MMA 中的可能作用机制亦需进一步研究。

总之,miR-9-1 在MMA 患儿血浆中显著下调, 维生素B12 治疗后显著上调,且在尿中甲基丙二酸 值越增高,miR-9-1 下调越明显,可作为潜在的生 物标记物辅助MMA 的诊断,从而监测病情的变化。

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