中国当代儿科杂志  2017, Vol. 19 Issue (7): 734-740   PDF    
先天性胆汁酸合成障碍2型一家系临床和遗传学分析:两个AKR1D1新突变的识别
程映, 郭丽, 邓梅, 宋元宗    
暨南大学附属第一医院儿科, 广东 广州 510630
通信作者: 宋元宗,男,教授,主任医师。
摘要: 先天性胆汁酸合成障碍2型(CBAS2)是编码Δ4-3-氧固醇5β-还原酶的AKR1D1基因突变导致的常染色体隐性遗传病,以胆汁淤积性黄疸为主要临床表现,伴脂肪和脂溶性维生素吸收障碍。本文报道了1例CBAS2患儿的临床特点及AKR1D1基因突变分析结果。患儿为8个月男婴,因发现全身皮肤、巩膜黄染7月余就诊。体查发现患儿发育、营养差;皮肤、巩膜轻度黄染;肝右肋下8 cm,质地中等,脾脏不大。血生化结果发现转氨酶和总胆红素升高,以结合胆红素升高为主,但γ-谷氨酰转肽酶和总胆汁酸水平基本正常。肝脏组织学检查见胆管排列紊乱,多核巨细胞易见,肝细胞内明显淤胆,伴间质纤维组织增生及淋巴细胞浸润。代谢性肝病组套二代测序及Sanger测序验证结果证实患儿AKR1D1基因型为c.579+2delT/c.853C > T(p.Q285X),两个突变均为新突变,且分别来源于其母亲和父亲。患儿最终确诊为CBAS2,给予鹅去氧胆酸治疗后,肝功能明显好转,肝肿大逐渐改善。3个月后随访,肝脏右肋下2.5 cm可及,质软,肝功能各项指标已恢复正常。
关键词先天性胆汁酸合成障碍2型     AKR1D1基因     基因突变     儿童    
Clinical feature and genetic analysis of a family affected by congenital bile acid synthesis defect type 2: identifcation of 2 novel mutations in AKR1D1 gene
CHENG Ying, GUO Li, DENG Mei, SONG Yuan-Zong    
Department of Pediatrics, First Affiliated Hospital, Jinan University, Guangzhou 510630, China
Corresponding author: Song Y-Z, E-mail: Songyuanzong@vip.tom.com
Abstract: Congenital bile acid synthesis defect type 2 (CBAS2) is an autosomal recessive disorder caused by biallelic mutations of AKR1D1 gene, which encodes the Δ4-3-oxo-steroid 5β-reductase. Cholestatic jaundice is the main clinical manifestation, accompanied by malabsorption of fat and fat-soluble vitamins. This paper reported the clinical and genetic features of a CBAS2 patient definitely diagnosed by AKR1D1 genetic analysis. An 8-monthold male infant was referred to the hospital with the complaint of jaundiced skin and sclera over 7 months. On physical examination, growth retardation and malnutrition were discovered besides mild jaundice of the skin and sclera. The liver was palpable 8 cm below the right subcostal margin with medium texture, and the spleen was not enlarged. On liver function test, elevated levels of bilirubin (predominantly conjugated bilirubin) and transaminases were detected, but serum total bile acids and γ-glutamyl transpeptidase levels were within the normal ranges. Liver histopathologic analysis showed disorganized bile ducts, obvious multinucleated giant cells, significant cholestasis in hepatocytes, together with portal and interstitial fibrosis and lymphocytic infiltration. Via next generation sequencing analysis and Sanger sequencing confirmation, the infant proved to be a compound heterozygote of the AKR1D1 variants c.579+2delT and c.853C > T(p.Q285X), two novel mutations originated from his mother and father, respectively. CBAS2 was thus definitely diagnosed, and chenodeoxycholic acid was given orally. As a result, the abnormal liver function and hepatomegaly were improved gradually. On a follow-up 3 months later, a soft liver was palpable 2.5 cm below the right subcostal margin, and all liver function indices recovered to normal ranges.
Key words: Congenital bile acid synthesis defect type 2     AKR1D1 gene     Mutation     Child    

先天性胆汁酸合成障碍2型(congenital bile acid synthesis defect type 2, CBAS2),又称为原发性Δ4-3-氧固醇5β-还原酶缺陷病,是一种由AKR1D1基因突变引起的常染色体隐性遗传病[1]。其主要的临床表现为胆汁淤积性黄疸,脂肪、脂溶性维生素吸收障碍,血清转氨酶升高,但血清总胆汁酸和γ-谷氨酰转肽酶正常[1]。AKR1D1基因位于染色体7q32-33,全长42 kb,包含9个外显子,编码2.7 kb的mRNA分子,其蛋白质产物为含326个氨基酸的Δ4-3-氧固醇5β-还原酶[2-3]。该酶主要表达在肝细胞,作为一种NADPH依赖性酶,催化所有含3-氧-4烯结构的类固醇激素和胆汁酸前体的还原反应[2-4]

AKR1D1基因分析是CBAS2确诊的可靠依据。迄今为止,国外文献已报道12种AKR1D1基因突变,包括2种移码突变,2种无义突变和8种错义突变[5-10]。2010年,Zhao等[10]首次在2位中国大陆患者中检测出AKR1D1基因突变,说明我国也存在CBAS2患者;但目前国内涉及本病的文献仅有3篇综述[11-13],CBAS2的临床诊断和治疗经验尚需要进一步积累。本文报道1例CBAS2患儿的临床和AKR1D1基因突变特征,希望作为引玉之砖,为本病确诊提供分子依据,并为后续诊治研究提供参考。

1 资料与方法 1.1 病例介绍

患儿,男,8个月4 d,因“全身皮肤、巩膜黄染7月余”入院。患儿生后约半个月开始出现皮肤、巩膜黄染,伴尿黄、陶土样大便,家属未予重视。生后1个月8 d时到当地医院就诊,查肝功能:总胆红素228.5 μmol/L,结合胆红素97.7 μmol/L,非结合胆红素130.8 μmol/L,丙氨酸氨基转移酶119 U/L,门冬氨酸氨基转移酶190 U/L,γ-谷氨酰转肽酶45 U/L。后复查肝功能仍异常,但病因不明(表 1)。3个月10 d时在另一医院行“腹腔镜探查+胆道探查+胆道造影+胆道冲洗+肝活检术”,肝脏病理活检示:肝细胞明显增大,可见大量多核巨肝细胞和明显淤胆,肝窦稍扩张充血,门管区小胆管和纤维组织轻度增生,呈胆汁淤积性肝炎病理改变(图 1)。诊断为“胆汁淤积性肝病”,并给予百佳力(无乳糖中链甘油三酯配方奶粉)喂养及口服“联苯双酯”等药物,黄疸逐渐减轻,但肝功能异常持续(表 1)。为进一步诊治而至我院儿科就诊。患儿自起病以来,精神、睡眠尚可,胃纳差,米糊或奶粉每日约600 mL,大便为黄色,小便正常,体重增长缓慢。

表 1 患儿历次生化检查结果

图 1 患儿肝脏组织学检查结果 (A~B:苏木精-伊红染色,C:免疫组化,D:Masson染色,×200)可见肝小叶结构絮乱,肝细胞胞质呈细颗粒样或“毛玻璃”状,可见多核巨细胞,肝细胞淤胆(A),同时细胞间质(A)和汇管区(B)有大量淋巴细胞浸润;CK8蛋白免疫组化染色显示汇管区边缘小胆管轻度增生(C);而Masson染色显示汇管区和细胞间质纤维组织增生(D)。以上改变,符合胆汁淤积性肝炎病理特征。

患儿系第2胎第2产,出生胎龄40周,经阴道分娩出生,出生体重2.85 kg,身长47.0 cm,出生时无窒息史。父母体健,非近亲结婚。否认家族类似病史及传染病史。

体格检查:体重6.85 kg( < -2 SD),身长65 cm( < -3 SD),头围42 cm( < -2 SD)。神志清楚,精神可,发育、营养差。全身皮肤、巩膜轻度黄染,无皮疹及皮下出血点,浅表淋巴结未触及肿大。前囟平软,大小约1 cm×1 cm。唇红,咽无充血,未见脓性分泌物。颈软,无抵抗,气管居中,胸廓对称,无明显畸形,三凹征(-),双肺呼吸音清,未闻及干、湿性罗音。心律齐,心音有力,未闻及病理性杂音。腹稍饱满,肝右肋下8 cm,质地中等,脾肋下未及,移动性浊音(-),肠鸣音正常。脊柱、四肢无畸形,肛门及外生殖器无异常。腹壁、膝腱和跟腱等生理反射可引出,克氏、布氏和巴氏征均阴性。

辅助检查:入院后查血常规大致正常。生化检查发现肝功能异常(表 1)。血清锌4.9 µmol/L(参考值11.47~25.5 µmol/L),25-(OH)D 5.89 ng/mL(参考值30~100 ng/mL)。

1.2 代谢性肝病组套二代测序

用EDTA抗凝管收集患儿静脉血2 mL,并用Blood DNA Mini kit试剂盒(杭州新景生物试剂开发有限公司)提取患儿基因组DNA 5 μg。Covaris S2超声仪将基因组DNA打断至约150 bp片段长度,随后片段化DNA经末端补平修复,两端加A,连接adaptor,扩增和纯化后,与探针混于杂交体系中,建立含有与代谢性肝病相关基因(JAG1、NOTCH2、ATP8B1、ABCB11等249个基因)的全基因组文库。用液相捕获试剂盒(北京迈基诺基因科技股份有限公司)捕获上述目标基因文库,然后利用新一代测序仪HiSeq2500(Illumina公司,美国)进行高通量测序,得出数据后进行基因序列的生物信息学分析,找出致病基因并判断其突变性质。

1.3 Sanger测序验证

根据二代测序检测结果,对患儿及其父母DNA标本AKR1D1突变基因进行Sanger测序验证。所用引物(表 2)根据AKR1D1基因的DNA序列使用Primer Premier 5.0软件设计,由北京迈基诺基因科技股份有限公司合成。聚合酶链反应体系为:2×Goldstar Buffer Mix 10 μL(北京康为世纪生物科技有限公司),上、下游引物各1 μL,DNA 1 μL,最后灭菌双蒸水7 μL至总体积为20 μL。反应条件为:95℃预变性10 min;随后分为4步,即第1步94℃变性30 s,64℃退火30 s,72℃延伸45 s,共3个循环;第2步94℃变性30 s,62℃退火30 s,72℃延伸45 s,共5个循环;第3步94℃变性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸45 s,共10个循环;第4步94℃变性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸45 s,共17个循环;最后再72℃延伸5 min。

表 2 AKR1D1基因突变位点的Sanger测序引物

聚合酶链反应产物经琼脂糖凝胶电泳切胶纯化,由北京迈基诺基因科技股份有限公司测序。应用Chromas软件对测序结果进行分析,并应用DNAMAN软件与AKR1D1基因组参考序列进行比对(Ensemble Genome Browser: ENST00000122787)。突变的命名根据相关文献[14-15]

1.4 生物信息学分析

采用Human Splicing Finder(HSF, URL:http://www.umd.be/HSF3/)预测基因变异是否影响剪接,同时应用SWISS-MODEL软件(http://swissmodel.expasy.org/)分析变异前后AKR1D1蛋白质三级结构变化,推测基因变异影响蛋白质功能的可能机制。

本研究经暨南大学附属第一医院医学伦理委员会批准,并获得患儿父母签署书面知情同意书。

2 结果 2.1 遗传学分析结果

代谢性肝病组套分析结果显示:患儿AKR1D1基因检测到2个突变,其中c.579+2delT为第5内含子的5' 端经典剪接位点的缺失突变,而c.853C > T(p.Q285X)为外显子7的无义突变(图 2)。Sanger测序验证证实,患儿为上述突变的复合杂合子,而其母亲和父亲分别为相应突变携带者(图 3)。

图 2 患儿AKR1D1基因代谢性肝病组套分析结果 上图为c.579+2delT突变,红框内可见AKR1D1基因的编码区第579+2位的野生型胸腺嘧啶T部分缺失;下图为c.853C > T(p.Q285X)突变,红框内可见AKR1D1基因的编码区第853位的野生型胞嘧啶C部分突变为胸腺嘧啶T。

图 3 患儿及其父母AKR1D1基因Sanger测序验证结果 患儿为c.579+2delT突变和c.853C > T(p.Q285X)突变的复合杂合子;父亲为c.853C > T(p.Q285X)突变携带者;母亲为c.579+2delT(Splicing)突变携带者。

查阅知网、万方、维普、美国Pubmed和人类基因突变数据库(human gene mutation database, HGMD),均未见AKR1D1基因c.579+2delT和c.853C > T(p.Q285X)突变的报道。HSF预测结果提示,c.579+2delT突变对野生型供体位点具有强破坏性,将产生新的剪接受体位点(野生型CV值为20.94,突变型CV值为71.9,ΔCV值为+243.36%),从而影响前体mRNA剪接,阻碍AKR1D1蛋白(Δ4-3-氧固醇5β-还原酶)的正常合成。SWISS-MODEL预测并构建野生型和突变型AKR1D1蛋白的三维结构,结果显示,突变c.853C > T导致AKR1D1蛋白翻译提前终止,致使突变型AKR1D1蛋白的三维结构缺失1个α-螺旋(图 4)。

图 4 AKR1D1蛋白质三维结构模型 A:显示野生型Δ4-3-氧固醇5β-还原酶,B:显示c.853C > T(p.Q285X)突变发生后的Δ4-3-氧固醇5β-还原酶。与野生型Δ4-3-氧固醇5β-还原酶(A)相比,突变型(B)C端缺失了一个α-螺旋(红框中紫色部分)。

2.2 治疗与结局

因病程中总胆汁酸水平基本正常,患儿以“1.先天性胆汁酸合成障碍?2.维生素D缺乏症;3.锌缺乏症”收住儿科。根据患儿临床特点及基因分析结果,患儿胆汁淤积病因确定为CBAS2,予口服鹅脱氧胆酸,同时给予康普力星补锌,并补充罗盖全、维生素AD和E等脂溶性维生素治疗半个月,患儿肝肿大和肝功能逐渐改善后出院。出院后继续以上治疗,3个月门诊复查,体重7.8 kg( < -2SD),身长69.5 cm( < -2SD),头围44.5 cm( > -2SD),黄疸完全消退,肝脏右肋下2.5 cm可及,质地软,且肝功能指标基本恢复正常。

3 讨论

1988年Setchell等[16]首次报道了2例Δ4-3-氧固醇5β-还原酶缺陷病患儿。2003年,Lemonde等[5]提出AKR1D1基因突变为Δ4-3-氧固醇5β-还原酶缺陷病的病因,并将此病命名为CBAS2。研究发现酪氨酸血症1型[17]、新生儿血色沉着病[7, 18-19]和乙型肝炎[5]等疾病可继发Δ4-3-氧固醇5β-还原酶缺陷,与CBAS2鉴别困难。目前认为基因检测可用于确诊CBAS2,亦是鉴别CBAS2与继发性Δ4-3-氧固醇5β-还原酶缺陷病的唯一方法[7, 20]。本例患儿其主要临床表现为胆汁淤积性黄疸,伴有生长发育迟缓。多次生化检查发现血清转氨酶升高,总胆红素升高,且以结合胆红素为主,但γ-谷氨酰转肽酶和总胆汁酸基本正常。肝脏组织学检查示,肝小叶结构絮乱,肝细胞胞质呈细颗粒样或“毛玻璃”状,可见多核巨细胞,肝细胞内明显淤胆,间质和汇管区有大量淋巴细胞浸润,纤维组织和小胆管轻度增生。上述表现为典型CBAS2临床特点[1],但仅根据临床特点仍无法明确具体病因。本研究行代谢性肝病组套分析结合Sanger测序验证后,发现患儿为AKR1D1基因突变的c.579+2delT及c.853C > T(p.Q285X)复合杂合子,前者为来自母亲的剪接位点突变,后者为父源性无义突变,为CBAS2确诊提供了实验依据。

Δ4-3-氧固醇5β-还原酶拥有一个具有催化活性的核心结构域,此结构域中包括NAD(P)(H)结合区、活性区和底物结合位点[21]。该酶在NADPH的辅助下,在核心结构域进行双键还原反应,负责催化C-4/C-5双键结合在Δ4-3-酮类固醇上形成A/B环交接点,使平面类固醇产生A/B cis环,最终使胆汁酸具有兼性亲水亲脂特征,能够发挥其乳化脂肪和胆固醇的生理功能[4, 21-22]。本研究患儿为AKR1D1基因无义突变c.853C > T导致AKR1D1蛋白截短,其三级结构缺失1个α-螺旋,致使该蛋白核心结构域中的部分NAD(P)(H)结合区受损,最终影响酶蛋白活性;而突变c.579+2delT为新的剪接位点突变,经HSF软件预测,可导致mRNA影响剪接异常,产生异常蛋白,从而阻碍AKR1D1蛋白的正常合成。

CBAS2患者发病的关键病理生理环节是Δ4-3-氧固醇5β-还原酶的上游胆汁酸中间代谢物蓄积,而下游正常胆汁酸产物合成不足。口服初级胆汁酸,包括胆酸和鹅去氧胆酸,不仅可以提供人体必需的初级胆汁酸,而且可通过负反馈作用抑制胆固醇7α-羟化酶的表达,从而抑制异常胆汁酸的合成,减少肝毒性胆汁酸中间代谢物的产生,故本病采用初级胆汁酸替代治疗,可改善肝功能,避免肝脏进一步损害[8, 23]。肝移植是经药物治疗无法控制病情患儿的唯一选择,目前为止,仅有1例患儿进行了肝移植,术后2年10个月随访,预后良好[5]。本例患儿口服鹅去氧胆酸后肝肿大和肝功能进行性改善,暂无肝脏移植指征,但其远期预后有待随访观察。

本文系统性分析了1例CBAS2患儿的临床症状、体征和实验室检查特点,确诊患儿为AKR1D1基因新突变导致的CBAS2,并通过鹅去氧胆酸治疗取得良好效果。本研究扩展了AKR1D1基因突变谱,并为患者分子诊断、家系遗传咨询及产前诊断提供了依据。

参考文献
[1] Clayton PT. Disorders of bile acid synthesis[J]. J Inherit Metab Dis, 2011, 34(3): 593–604. DOI:10.1007/s10545-010-9259-3
[2] Kondo KH, Kai MH, Setoguchi Y, et al. Cloning and expression of cDNA of human delta 4-3-oxosteroid 5 beta-reductase and substrate specifcity of the expressed enzyme[J]. Eur J Biochem, 1994, 219(1-2): 357–363. DOI:10.1111/ejb.1994.219.issue-1-2
[3] Charbonneau A, The VL. Genomic organization of a human 5beta-reductase and its pseudogene and substrate selectivity of the expressed enzyme[J]. Biochim Biophys Acta, 2001, 1517(2): 228–235. DOI:10.1016/S0167-4781(00)00278-5
[4] Di Costanzo L, Drury JE, Christianson DW, et al. Structure and catalytic mechanism of human steroid 5beta-reductase (AKR1D1)[J]. Mol Cell Endocrinol, 2009, 301(1-2): 191–198. DOI:10.1016/j.mce.2008.09.013
[5] Lemonde HA, Custard EJ, Bouquet J, et al. Mutations in SRD5B1(AKR1D1), the gene encoding delta(4)-3-oxosteroid 5beta-reductase, in hepatitis and liver failure in infancy[J]. Gut, 2003, 52(10): 1494–1499. DOI:10.1136/gut.52.10.1494
[6] Gonzales E, Cresteil D, Baussan C, et al. SRD5B1(AKR1D1) gene analysis in delta(4)-3-oxosteroid 5beta-reductase deficiency:evidence for primary genetic defect[J]. J Hepatol, 2004, 40(4): 716–718.
[7] Ueki I, Kimura A, Chen HL, et al. SRD5B1 gene analysis needed for the accurate diagnosis of primary 3-oxo-Delta4-steroid 5beta-reductase defciency[J]. J Gastroenterol Hepatol, 2009, 24(5): 776–785. DOI:10.1111/jgh.2009.24.issue-5
[8] Seki Y, Mizuochi T, Kimura A, et al. Two neonatal cholestasis patients with mutations in the SRD5B1(AKR1D1) gene:diagnosis and bile acid profiles during chenodeoxycholic acid treatment[J]. J Inherit Metab Dis, 2013, 36(3): 565–573. DOI:10.1007/s10545-012-9526-6
[9] Morgan NV, Hartley JL, Setchell KD, et al. A combination of mutations in AKR1D1 and SKIV2L in a family with severe infantile liver disease[J]. Orphanet J Rare Dis, 2013, 8: 74. DOI:10.1186/1750-1172-8-74
[10] Zhao J, Fang LJ, Setchell KD, et al. Primary Δ4-3-oxosteroid 5β-reductase deficiency:two cases in China[J]. World J Gastroenterol, 2012, 18(47): 7113–7117. DOI:10.3748/wjg.v18.i47.7113
[11] 方玲娟, 王建设. 先天性胆汁酸合成障碍与胆汁淤积性肝病[J]. 临床肝胆病杂志, 2010, 26(6): 585–588.
[12] 代东伶. 先天性胆汁酸合成障碍[J]. 临床儿科杂志, 2015, 33(4): 301–305.
[13] 胡长霞, 黄志华. 先天性胆汁酸合成障碍的诊治[J]. 中国临床医生, 2012, 40(11): 13–15. DOI:10.3969/j.issn.1008-1089.2012.11.005
[14] den Dunnen JT, Antonarakis SE. Mutation nomenclature extensions and suggestions to describe complex mutations:a discussion[J]. Hum Mutat, 2000, 15(1): 7–12. DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(200001)15:1<>1.0.CO;2-B
[15] den Dunnen JT, Antonarakis SE. Nomenclature for the description of human sequence variations[J]. Hum Genet, 2001, 109(1): 121–124. DOI:10.1007/s004390100505
[16] Setchell KD, Suchy FJ, Welsh MB, et al. Delta 4-3-oxosteroid 5 beta-reductase deficiency described in identical twins with neonatal hepatitis. A new inborn error in bile acid synthesis[J]. J Clin Invest, 1988, 82(6): 2148–2157. DOI:10.1172/JCI113837
[17] Clayton PT, Patel E, Lawson AM, et al. 3-oxo-delta 4 bile acids in liver disease[J]. Lancet, 1988, 1(8597): 1283–1284.
[18] Shneider BL, Setchell KD, Whitington PF, et al. Delta 4-3-oxosteroid 5 beta-reductase deficiency causing neonatal liver failure and hemochromatosis[J]. J Pediatr, 1994, 124(2): 234–238. DOI:10.1016/S0022-3476(94)70310-8
[19] Siafakas CG, Jonas MM, Perez-Atayde AR. Abnormal bile acid metabolism and neonatal hemochromatosis:a subset with poor prognosis[J]. J Pediatr Gastroenterol Nutr, 1997, 25(3): 321–326. DOI:10.1097/00005176-199709000-00015
[20] Yanagi T, Mizuochi T, Homma K, et al. Distinguishing primary from secondary Δ(4)-3-oxosteroid 5β-reductase (SRD5B1, AKR1D1) deficiency by urinary steroid analysis[J]. Clin Endocrinol (Oxf), 2015, 82(3): 346–351. DOI:10.1111/cen.2015.82.issue-3
[21] Russell DW, Setchell KD. Bile acid biosynthesis[J]. Biochemistry, 1992, 31(20): 4737–4749. DOI:10.1021/bi00135a001
[22] Rižner TL, Penning TM. Role of aldo-keto reductase family 1(AKR1) enzymes in human steroid metabolism[J]. Steroids, 2014, 79: 49–63. DOI:10.1016/j.steroids.2013.10.012
[23] Gonzales E, Gerhardt MF, Fabre M, et al. Oral cholic acid for hereditary defects of primary bile acid synthesis:a safe and effective long-term therapy[J]. Gastroenterology, 2009, 137(4): 1310–1320.e1-3. DOI:10.1053/j.gastro.2009.07.043