中国当代儿科杂志  2020, Vol. 22 Issue (7): 734-738  DOI: 10.7499/j.issn.1008-8830.2002007

引用本文  

饶春宝, 雒东, 林子添, 等. 长链非编码RNA linc00467在儿童急性髓系白血病中的表达及耐药中的作用研究[J]. 中国当代儿科杂志, 2020, 22(7): 734-738.
RAO Chun-Bao, LUO Dong, LIN Zi-Tian, et al. Expression of long non-coding RNA linc00467 in childhood acute myeloid leukemia and its role in drug resistance[J]. Chinese Journal of Contemporary Pediatrics, 2020, 22(7): 734-738.

基金项目

广东省自然科学基金(2017A030310588);东莞市社会科技发展重点项目(2017507150100445;20185071501001628)

作者简介

饶春宝, 男, 博士, 助理研究员

通信作者

陆小梅, 女, 主任技师, 教授。Email:luxm@dgp-institute.com

文章历史

收稿日期:2020-02-03
接受日期:2020-05-19
长链非编码RNA linc00467在儿童急性髓系白血病中的表达及耐药中的作用研究
饶春宝1, 雒东1, 林子添1, 谢明玉2, 胡媛2, 彭琪2, 江华3, 张振洪2, 陆小梅1,2    
1. 东莞市儿科研究所遗传与感染性疾病重点实验室, 广东 东莞 523327;
2. 东莞市儿童医院科研中心, 广东 东莞 523327;
3. 广州市妇女儿童医疗中心血液肿瘤科, 广东 广州 510000
摘要目的 研究长链非编码RNA linc00467在儿童急性髓系白血病(AML)中的表达及功能。方法 采集2016年5月至2018年6月确诊的5例儿童AML病例的骨髓标本,以进行骨髓检查提示为正常的3例儿童骨髓标本作为对照。通过实时荧光定量PCR检测并比较linc00467在两组样本中的表达量。通过慢病毒系统在AML细胞(HL-60)中过表达linc00467(linc00467过表达组),以表达绿色荧光蛋白(GFP)的空载体转入AML细胞作为对照(GFP对照组);通过慢病毒系统将干扰序列插入AML细胞中(sh-linc00467干扰组),以插入随机序列作为对照(sh-NC对照组)。检测各组细胞增殖情况及对阿霉素耐药性的影响。结果 与对照组儿童相比,linc00467在儿童AML中表达上调。过表达与干扰linc00467表达对细胞增殖无明显影响(P > 0.05)。相比于GFP对照组,过表达linc00467在0.1、0.2、0.3、0.4、0.5 μg/mL阿霉素浓度作用下均可增强HL-60细胞活性(P < 0.05)。相比于sh-NC对照组,干扰linc00467的表达在0.1、0.2、0.3、0.4、0.5 μg/mL阿霉素浓度作用下均可降低HL-60细胞活性(P < 0.05)。与未处理组相比,阿霉素处理HL-60细胞后linc00467表达量升高(P < 0.05)。结论 linc00467有促进AML细胞对阿霉素耐药的生物学功能,为AML新的治疗药物开发提供了依据。
关键词急性髓系白血病    长链非编码RNA    linc00467    阿霉素    耐药    儿童    
Expression of long non-coding RNA linc00467 in childhood acute myeloid leukemia and its role in drug resistance
RAO Chun-Bao1, LUO Dong1, LIN Zi-Tian1, XIE Ming-Yu2, HU Yuan2, PENG Qi2, JIANG Hua3, ZHANG Zhen-Hong2, LU Xiao-Mei1,2    
Key Laboratory of Genetics and Infectious Diseases, Dongguan Institute of Pediatrics, Dongguan, Guangdong 523327, China
Abstract: Objective To study the expression and function of long non-coding RNA linc00467 in childhood acute myeloid leukemia (AML). Methods Bone marrow samples were collected from 5 children with AML who were diagnosed from May 2016 to June 2018. Normal bone marrow samples based on bone marrow examination were collected from 3 children as controls. Quantitative real-time PCR was used to measure the expression of linc00467 in the two groups. A lentivirus system was used to achieve overexpression of linc00467 in AML cells (HL-60) (linc00467 overexpression group), and empty vector expressing green fluorescent protein (GFP) was transfected into AML cells to establish a GFP control group. A lentivirus system was used to insert an interfering sequence into AML cells (sh-linc00467 interfering group), and a random sequence was inserted to establish an sh-NC control group. Cell proliferation and resistance to doxorubicin were observed for all groups. Results Compared with the normal control group, the children with AML had a significant increase in linc00467 (P=0.018). Overexpression and interference with linc00467 expression had no significant effect on cell proliferation. Compared with the GFP control group, the linc00467 overexpression group had a significant increase in the viability of HL-60 cells at the adriamycin concentrations of 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, and 0.5 μg/mL (P < 0.05). Compared with the sh-NC control group, the sh-linc00467 interfering group had a significant reduction in the viability of HL-60 cells at the adriamycin concentrations of 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, and 0.5 μg/mL (P < 0.05). Compared with the untreated group, the adriamycin treatment group had a significant increase in the expression of linc00467 in HL-60 cells (P < 0.05). Conclusions This study reveals the biological function of linc00467 to promote the resistance to adriamycin in AML, which provides a basis for developing new therapeutic drugs for AML.
Key words: Acute myeloid leukemia    Long non-coding RNA    Linc00467    Adriamycin    Drug resistance    Child    

急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)是髓系造血干/祖细胞恶性疾病,以骨髓和外周血中原始和幼稚髓系细胞异常增生为主要特征。近年来儿童AML的总体生存率可达60%左右,但是难以进一步提高[1]。目前,化疗和造血干细胞移植是AML治疗的常用方法,然而耐药性的出现严重影响其治疗效果,耐药性复发是导致AML患者死亡的最主要原因[2]。因此,深入研究儿童AML的耐药机制具有重要的医学价值。

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)最早是由Okazaki等[3]在测序过程中发现的一类转录本长度超过200 nt的功能性RNA分子。目前许多研究已证实lncRNAs与白血病的发生、发展、临床表现和预后有密切联系,在靶向分子治疗和预后评价方面具有良好的应用前景[4-6]。lnc RNA linc00467全长711 bp,含有6个外显子。据报道,linc00467在神经母细胞瘤[7]、肺腺癌[8]、肝癌[9]、宫颈癌[10]、结直肠癌[11]等多种肿瘤中发挥作用。本课题组前期通过生物信息学方法,分析TCGA肿瘤数据库中AML患者linc00467的表达水平及预后,发现linc00467高表达的患者其生存期要显著低于linc00467低/中表达的患者。然而,linc00467在白血病中的具体功能作用目前尚未见文献报道。本研究对linc00467在儿童AML中的表达及在增殖与耐药中的作用进行了初步的探索。

1 资料与方法 1.1 研究对象

采集2016年5月至2018年6月于广州市妇女儿童医疗中心确诊的5例儿童AML病例的骨髓标本,其中男3例,女2例,年龄4~8岁。本研究已获得广州市妇女儿童医疗中心伦理委员会批准(2015012608)及监护人书面知情同意。另采集2018年1~6月在东莞市儿童医院儿童血液科进行骨髓检查提示为正常的3例儿童骨髓标本作为对照,其中男2例,女1例,年龄4~6岁。本研究获得东莞市儿童医院伦理委员会批准及监护人书面知情同意。人AML细胞HL-60购买自中国典型培养物保藏中心细胞库,加入含10%胎牛血清的RPMI 1640培养基,培养于5%CO2、37℃培养箱中。

1.2 主要试剂

淋巴细胞分离液购买自北京索莱宝科技有限公司,TRIzol、PowerUpTM SYBRTM Green Master Mix购买自赛默飞世尔科技(中国)有限公司,PrimeScriptTM IV 1st strand cDNA Synthesis Mix购买自宝生物工程(大连)有限公司,阿霉素购买自华中海威(北京)基因科技有限公司,CCK-8购自于同仁化学研究所,LipoJetTM转染试剂购买自思科生物科技有限公司。实时荧光定量PCR引物合成自上海生工生物工程有限责任公司,内参GAPDH正向引物:5'-CATCCATGACAACTTTGGTATC-3',反向引物:5'-CCATCACGCCACAGTTTC-3';linc00467正向引物:5'-CTGGTTGTTCAGCACCTTCG-3',反向引物:5'-GGATCGGTGCTGGTTTTGGT-3'。

1.3 骨髓单个核细胞的采集与储存

运用淋巴细胞分离液,按照试剂说明书进行,主要操作步骤如下:(1)每个患者常规抽取骨髓液4 mL于肝素抗凝管中。(2)取一空管,加入淋巴细胞分离液3 mL,沿管壁缓慢加入等量骨髓标本,1 500 r/min离心20 min。(3)吸取分离界面层的单个核细胞于1 mL EP管中,加入1 mL 0.84%氯化铵,混匀,静置10 min以充分裂解残余红细胞,1 500 r/min离心5 min。(4)弃上清,加入1 mL生理盐水,将细胞洗涤1次,1 500 r/min离心5 min。(5)重复步骤(4)1次,弃上清,储存于-80℃冰箱中或者直接提取总RNA。

1.4 linc00467表达水平检测

采用TRIzol法进行总RNA的提取。采用PrimeScriptTM IV 1st strand cDNA Synthesis Mix进行cDNA合成。实时荧光定量PCR采用PowerUpTM SYBRTM Green Master Mix,在ABI 7500实时荧光定量PCR仪上进行。荧光定量PCR反应体系:PowerUpTM SYBRTM Green Master Mix 10 μL,上、下游引物各0.6 μL,cDNA模板0.3 μL,灭菌去离子水8.5 μL。反应条件:UDG酶激活,50℃ 2 min;95℃预变性2 min;95℃变性15 s,60℃退火/延伸1 min,40个循环。采用2-△△CT法比较基因相对表达量。

1.5 慢病毒介导的基因过表达与基因干扰

慢病毒包装系统为三质粒系统,组成为psPAX2、pMD2.G、PHBLV系列质粒。

1.5.1 基因过表达

分为绿色荧光蛋白(GFP)对照组和linc00467过表达组。主要步骤如下:(1)载体构建。linc00467基因序列参见NCBI参考序列NR_026761.2,人工合成linc00467基因序列后插入基因过表达慢病毒载体pHBLV-CMV-MCS-3flag-ZsGreen-T2A PURO的多克隆位点,应用表达GFP的空载体即为GFP对照组。(2)慢病毒包装。按照psPAX2 10 μg、pMD2.G 5 μg、PHBLV系列质粒10 μg、LipoJetTM转染试剂75 μL的体系,在转染前1 d接种于T75瓶培养中的293T细胞。转染6 h后换新鲜培养基。转染72 h后收集病毒上清,置于-80℃备用。(3)病毒感染目的细胞。将30×104 HL-60接种于6孔板,于接种当天加入8 μg/mL Polybrene和100 μL病毒液,感染24 h后换成新鲜正常培养基,感染48 h后添加10 μg/mL嘌呤霉素进行感染阳性细胞的筛选。

1.5.2 基因干扰

分为sh-NC对照组和sh-linc00467干扰组。主要步骤如下:(1)载体构建。sh-NC-F:5'-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3',sh-NC-R:5'-ACGUGACACGUUCGGAGAATT-3';sh-linc00467-F:5'-CAGGGAGGUUUAAUAGACATT-3',sh-linc00467-R:5'-UGUCUAUUAAACCUCCC-UGTT-3'。将siRNA双链退火后插入pHBLV-U6-ShRNA-CMV-ZsGreen-PGK-PURO载体的多克隆位点。(2)慢病毒包装与病毒感染目的细胞的方法与基因过表达中的方法一致。

1.6 白血病细胞HL-60的增殖实验

将3×105个细胞接种于6孔板,置于培养箱内孵育,分别在24、48、72 h后进行细胞计数,绘制细胞生长曲线。

1.7 白血病细胞HL-60的阿霉素耐药检测

将HL-60细胞接种于96孔板,分成6组,每组5个孔,每个孔100 μL培养基,1.5×104个细胞。接种细胞后立即加入阿霉素,阿霉素终浓度分别为0、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5 μg/mL。24 h后CCK-8检测细胞存活率。

1.8 阿霉素处理细胞后linc00467表达检测

将3×105个细胞接种于12孔板,对照组不加药,实验组分别加入终浓度为0.03、0.06、0.12 μg/mL的阿霉素,置于细胞培养箱中培养24 h、48 h后进行总RNA的提取和逆转录,实时荧光定量PCR检测linc00467的表达。

1.9 统计学分析

应用SPSS 21.0统计软件对数据进行统计学分析。计量资料采用均数±标准差(x±s)表示,两组间的比较应用两样本t检验。生存分析采用Kaplan-Meier生存分析进行。相关性分析采用Microsoft Excel的CORREL函数。P < 0.05为差异有统计学意义。

2 结果 2.1 linc00467在儿童AML患者中的表达

经实时荧光定量PCR检测,本研究中AML患儿的linc00467表达水平(11.7±4.8)明显高于对照组(1.2±0.6)。

2.2 过表达linc00467对白血病细胞耐药性的影响

实时荧光定量PCR结果显示linc00467过表达组linc00467相对表达量(5.67±0.34)明显高于GFP对照组(1.07±0.17)(t=-22.379,P < 0.01)。细胞生长曲线显示过表达linc00467对细胞增殖无明显影响(P > 0.05)。细胞耐药性实验结果显示,相比于GFP对照组,linc00467过表达组呈现明显增强的阿霉素耐药性(P < 0.05)。见图 1


图 1 过表达linc00467对白血病细胞增殖及阿霉素耐药性的影响 左图为GFP对照组及linc00467过表达组细胞生长曲线,两组不同时间点细胞计数比较差异均无统计学意义(P > 0.05)。右图为GFP对照组及linc00467过表达组细胞的阿霉素耐药性检测,a示与GFP对照组比较,P < 0.01;b示与GFP对照组比较,P < 0.05。
2.3 干扰linc00467表达对白血病细胞耐药性的影响

通过慢病毒基因干扰系统在HL-60细胞中干扰linc00467的表达,通过实时荧光定量PCR法检测linc00467的干扰水平,sh-NC对照组linc00467的表达水平为0.98±0.16,明显高于sh-linc00467干扰组(0.19±0.04)(t=10.64,P < 0.01)。细胞生长曲线显示linc00467基因干扰在接种后24 h、72 h检测对细胞增殖无明显影响,在48 h检测到轻微抑制细胞增殖(P < 0.05)。细胞耐药性实验结果显示,相比于sh-NC对照组,linc00467干扰组细胞对阿霉素耐药性明显降低(P < 0.05)。见图 2


图 2 干扰linc00467表达对白血病细胞增殖及阿霉素耐药性的影响 左图为sh-NC对照组及sh-linc00467干扰组细胞生长曲线,a示与sh-NC对照组比较,P < 0.05。右图为sh-NC对照组及sh-linc00467干扰组细胞的阿霉素耐药性检测,a示与sh-NC对照组比较,P < 0.01;b示与sh-NC对照组比较,P < 0.05。
2.4 阿霉素对HL-60细胞linc00467表达的影响

采用实时荧光定量PCR对阿霉素处理后的HL-60细胞进行linc00467表达的检测,结果表明,与未经阿霉素处理的对照组比较,不同剂量阿霉素处理HL-60细胞不同时间均可显著上调linc00467的表达(P < 0.01),见图 3


图 3 阿霉素处理促进linc00467的表达 a示与对照组比较,P < 0.01。
3 讨论

常规化疗仍然是治疗AML的主要方法,然而耐药现象的出现严重影响AML的治疗效果,AML耐药问题亟需更多的临床科研工作者去探索。本研究表明lncRNA linc00467在儿童AML中表达上调;本研究还通过基因过表达、基因干扰等技术证实linc00467可增强AML细胞的阿霉素耐药性。此外,本研究进一步发现阿霉素处理能够上调AML细胞linc00467的表达水平,这一正反馈调节可能加速AML患者耐药性的产生。

目前对于linc00467的研究并不多,既往研究提示linc00467与多种肿瘤密切相关,如促进肺癌细胞的增殖与迁移[12-13],促进肝癌的进展[14-15],但都限于实体瘤中,鲜有linc00467与白血病的相关报道,本研究揭示了linc00467可能具有促进白血病患者对治疗药物耐药的作用。

linc00467促进白血病细胞对阿霉素耐药的具体分子机制有待于进一步的研究。最近的研究表明,某些lncRNA通过直接与蛋白质结合而发挥其功能作用[16-17]。通过查阅starBase数据库(http://starbase.sysu.edu.cn/)发现,linc00467与RNA结合蛋白IGFBP2、IGFBP3具有潜在的结合能力。而IGFBP2是一种细胞自主性因子,其高表达与AML耐药性相关[18]。因此linc00467可能通过其结合蛋白IGFBP2调控AML细胞耐药,但这一假设尚需进一步的实验证实。本课题组将继续收集儿童AML样本,将这些样本分成初发组、非耐药组及耐药组,比较linc00467在各组样本中的表达差异,并深入研究其耐药机制。

综上,本研究发现了一个在儿童AML中高表达的lncRNA linc00467,linc00467表达水平可能与AML患者预后密切相关。linc00467增强白血病细胞对阿霉素的耐药性,同时,阿霉素可上调白血病细胞linc00467的表达。本研究揭示了AML患者对阿霉素耐药的一种新的机制,为AML的治疗和新药开发提供了依据。

参考文献
[1]
王妮娜. 儿童急性髓系白血病靶向治疗进展[J]. 中国当代儿科杂志, 2017, 19(7): 832-836. (0)
[2]
Ramos NR, Mo CC, Karp JE, et al. Current approaches in the treatment of relapsed and refractory acute myeloid leukemia[J]. J Clin Med, 2015, 4(4): 665-695. DOI:10.3390/jcm4040665 (0)
[3]
Okazaki Y, Furuno M, Kasukawa T, et al. Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60, 770 full-length cDNAs[J]. Nature, 2002, 420(6915): 563-573. DOI:10.1038/nature01266 (0)
[4]
Chen L, Hu N, Wang C, et al. HOTAIRM1 knockdown enhances cytarabine-induced cytotoxicity by suppression of glycolysis through the Wnt/β-catenin/PFKP pathway in acute myeloid leukemia cells[J]. Arch Biochem Biophys, 2020, 680: 108244. DOI:10.1016/j.abb.2019.108244 (0)
[5]
Wang D, Zeng T, Lin Z, et al. Long non-coding RNA SNHG5 regulates chemotherapy resistance through the miR-32/DNAJB9 axis in acute myeloid leukemia[J]. Biomed Pharmacother, 2020, 123: 109802. DOI:10.1016/j.biopha.2019.109802 (0)
[6]
Sun H, Sun Y, Chen Q, et al. LncRNA KCNQ1OT1 contributes to the progression and chemoresistance in acute myeloid leukemia by modulating Tspan3 through suppressing miR-193a-3p[J]. Life Sci, 2020, 241: 117161. DOI:10.1016/j.lfs.2019.117161 (0)
[7]
Atmadibrata B, Liu PY, Sokolowski N, et al. The novel long noncoding RNA linc00467 promotes cell survival but is down-regulated by N-Myc[J]. PLoS One, 2014, 9(2): e88112. DOI:10.1371/journal.pone.0088112 (0)
[8]
Ding H, Luo Y, Hu K, et al. Linc00467 promotes lung adenocarcinoma proliferation via sponging miR-20b-5p to activate CCND1 expression[J]. Onco Targets Ther, 2019, 12: 6733-6743. DOI:10.2147/OTT.S207748 (0)
[9]
Jiang W, Cheng X, Wang T, et al. LINC00467 promotes cell proliferation and metastasis by binding with IGF2BP3 to enhance the mRNA stability of TRAF5 in hepatocellular carcinoma[J]. J Gene Med, 2020, 22(3): e3134. (0)
[10]
Li GC, Xin L, Wang YS, et al. Long intervening noncoding 00467 RNA contributes to tumorigenesis by acting as a competing endogenous RNA against miR-107 in cervical cancer cells[J]. Am J Pathol, 2019, 189(11): 2293-2310. DOI:10.1016/j.ajpath.2019.07.012 (0)
[11]
李雪芹, 袁维堂, 刘佃温. 结直肠癌中长链非编码RNA LINC00467表达特征与预后分析[J]. 中华肿瘤防治杂志, 2017, 24(17): 1206-1208. (0)
[12]
Yang J, Liu Y, Mai X, et al. STAT1-induced upregulation of LINC00467 promotes the proliferation migration of lung adenocarcinoma cells by epigenetically silencing DKK1 to activate Wnt/β-catenin signaling pathway[J]. Biochem Biophys Res Commun, 2019, 514(1): 118-126. (0)
[13]
Wang X, Liu H, Shen K, et al. Long intergenic non-coding RNA 00467 promotes lung adenocarcinoma proliferation, migration and invasion by binding with EZH2 and repressing HTRA3 expression[J]. Mol Med Rep, 2019, 20(1): 640-654. (0)
[14]
Cai K, Li T, Guo L, et al. Long non-coding RNA LINC00467 regulates hepatocellular carcinoma progression by modulating miR-9-5p/PPARA expression[J]. Open Biol, 2019, 9(9): 190074. DOI:10.1098/rsob.190074 (0)
[15]
Zheng Y, Nie P, Xu S. Long noncoding RNA linc00467 plays an oncogenic role in hepatocellular carcinoma by regulating the miR-18a-5p/NEDD9 axis[J]. J Cell Biochem, 2020, 121(5-6): 3135-3144. DOI:10.1002/jcb.29581 (0)
[16]
Zhang A, Zhao JC, Kim J, et al. LncRNA HOTAIR enhances the androgen-receptor-mediated transcriptional program and drives castration-resistant prostate cancer[J]. Cell Rep, 2015, 13(1): 209-221. (0)
[17]
Yang F, Huo XS, Yuan SX, et al. Repression of the long noncoding RNA-LET by histone deacetylase 3 contributes to hypoxia-mediated metastasis[J]. Mol Cell, 2013, 49(6): 1083-1096. DOI:10.1016/j.molcel.2013.01.010 (0)
[18]
Kühnl A, Kaiser M, Neumann M, et al. High expression of IGFBP2 is associated with chemoresistance in adult acute myeloid leukemia[J]. Leuk Res, 2011, 35(12): 1585-1590. DOI:10.1016/j.leukres.2011.08.006 (0)